Finn Cilius Nielsen

Søgeresultater

• 2024

  Genomic alterations in the stepwise progression from normal mucosa to metastasizing oral squamous cell carcinoma

  Jensen, J. M., Sjöstedt, S. M. S., Carmona, J. L., Ahlborn, L. B., Vieira, F. G., Nielsen, F. C., Kiss, K., Grønhøj, C. & von Buchwald, C., 2024, I: Frontiers in Oncology. 14, 1450361.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

• Molecular subtyping improves breast cancer diagnosis in the Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

  Berg, T., Jensen, M. B., Celik, A., Talman, M. L., Misiakou, M. A., Knoop, A. S., Nielsen, F. C., Ejlertsen, B. & Rossing, M., 2024, I: JCI insight. 9, 7, 13 s., e178114.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  8 Downloads (Pure)
• 2023

  Multigene profiles to guide the use of neoadjuvant chemotherapy for breast cancer: a Copenhagen Breast Cancer Genomics Study

  Jensen, M-B., Pedersen, C. B., Misiakou, M-A., Talman, M. L. M., Gibson, L., Tange, U. B., Kledal, H., Vejborg, I., Kroman, N., Nielsen, F. C., Ejlertsen, B. & Rossing, M., 2023, I: npj Breast Cancer. 9, 8 s., 47.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• Neoepitope load, T cell signatures and PD-L2 as combined biomarker strategy for response to checkpoint inhibition immunotherapy

  Borch, A., Bjerregaard, A. M., Araujo Barbosa de Lima, V., Østrup, O., Yde, C. W., Eklund, A. C., Mau-Sørensen, M., Barra, C., Svane, I. M., Nielsen, F. C., Funt, S. A., Lassen, U. & Hadrup, S. R., 2023, I: Frontiers in Genetics. 14, 13 s., 1058605.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  13 Downloads (Pure)

• New pathogenic germline variants identified in mesothelioma

  Belcaid, L., Bertelsen, B., Wadt, K., Tuxen, I., Spanggaard, I., Højgaard, M., Sørensen, J. B., Ravn, J., Lassen, U., Nielsen, F. C., Rohrberg, K. & Westmose Yde, C., 2023, I: Lung Cancer. 179, 8 s., 107172.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  18 Downloads (Pure)

• Ovarian cancer pathology characteristics as predictors of variant pathogenicity in BRCA1 and BRCA2

  AOCS Group, CZECANCA Consortium, The Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2, Evidence-based Network for the Interpretation of Germline Mutant Alleles Consortium, HEBON Investigators & GEMO Study Collaborators, 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 12, s. 2283-2294 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  7 Citationer (Scopus)

  10 Downloads (Pure)

• The Incidence, Survival, and HPV Impact of Second Primary Cancer following Primary Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma: A 20-Year Retrospective and Population-Based Study

  Andersen, L., Jakobsen, K. K., Carlander, A. L. F., Garset-Zamani, M., Friborg, J., Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, F. C., Andersen, E., Grønhøj, C. & Buchwald, C. V., 2023, I: Viruses. 15, 1, 34.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  6 Citationer (Scopus)

  16 Downloads (Pure)
• 2022

  A catalog of curated breast cancer genes

  Bose, M., Benada, J., Thatte, J. V., Kinalis, S., Ejlertsen, B., Nielsen, F. C., Sørensen, C. S. & Rossing, M., 2022, I: Breast Cancer Research and Treatment. 191, s. 431-441

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  5 Citationer (Scopus)

  30 Downloads (Pure)

• Benchmarking full-length transcript single cell mRNA sequencing protocols

  Probst, V., Simonyan, A., Pacheco, F., Guo, Y., Nielsen, F. C. & Bagger, F. O., 2022, I: BMC Genomics. 23, 860.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  7 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• Differences in gene expression despite identical histomorphology in sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and metastases from colorectal adenocarcinoma

  Sjöstedt, S., Vieira, F. G., Karnov, K., Agander, T. K., Willemoe, G. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, F. C. & von Buchwald, C., 2022, I: APMIS. 130, 9, s. 551-559

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  17 Downloads (Pure)

• Extensive genomic analysis in patients with KRAS-mutated solid tumors shows high frequencies of concurrent alterations and potential targets but has limited clinical impact

  Jacobsen, I. C., Spanggaard, I., Højgaard, M., Belcaid, L., Qvortrup, C., Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Nielsen, F. C., Willemoe, G. L., Dam, M. S., Lassen, U. & Staal Rohrberg, K., 2022, I: Acta Oncologica. 61, 12, s. 1499-1506 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Impact of specific high-risk human papillomavirus genotypes on survival in oropharyngeal cancer

  Garset-Zamani, M., Carlander, A. F., Jakobsen, K. K., Friborg, J., Kiss, K., Marvig, R. L., Olsen, C., Nielsen, F. C., Andersen, E., Grønhøj, C. & von Buchwald, C., 2022, I: International Journal of Cancer. 150, 7, s. 1174-1183

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  18 Citationer (Scopus)

• Interpretable autoencoders trained on single cell sequencing data can transfer directly to data from unseen tissues

  Walbech, J. S., Kinalis, S., Winther, O., Nielsen, F. C. & Bagger, F. O., 2022, I: Cells. 11, 12 s., 85.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  35 Downloads (Pure)

• Intestinal metaplasia is a precursor lesion for sinonasal intestinal-type adenocarcinoma: genomic investigation of a case proving this hypothesis

  Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, F. G., Woller, N. C., Nielsen, F. C. & von Buchwald, C., jan. 2022, I: APMIS. 130, 1, s. 53-56 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• MicroRNA-9-3p: a novel predictor of neurological outcome after cardiac arrest

  Beske, R. P., Bache, S., Meyer, M. A. S., Kjærgaard, J., Bro-Jeppesen, J., Obling, L., Olsen, M. H., Rossing, M., Nielsen, F. C., Møller, K., Nielsen, N. & Hassager, C., 2022, I: European Heart Journal: Acute Cardiovascular Care. 11, 8, s. 609-616 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  7 Citationer (Scopus)

• Personalized circulating tumor DNA in patients with hepatocellular carcinoma: a pilot study

  Pommergaard, H. C., Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Andersen, C. L., Henriksen, T., Hasselby, J. P., Rostved, A. A., Sorensen, C. L., Rohrberg, K. S., Nielsen, F. C. & Rasmussen, A., 2022, I: Molecular Biology Reports. 49, 2, s. 1609-1616 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  11 Downloads (Pure)

• Polygenic risk modeling for prediction of epithelial ovarian cancer risk

  Dareng, E. O., Tyrer, J. P., Barnes, D. R., Jones, M. R., Yang, X., Aben, K. K. H., Adank, M. A., Agata, S., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Aravantinos, G., Arun, B. K., Augustinsson, A., Balmaña, J., Bandera, E. V., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Beeghly-Fadiel, A. & 39 flere, Benitez, J., Bermisheva, M., Bernardini, M. Q., Bjorge, L., Black, A., Bogdanova, N. V., Bonanni, B., Borg, A., Brenton, J. D., Budzilowska, A., Butzow, R., Buys, S. S., Cai, H., Caligo, M. A., Campbell, I., Cannioto, R., Cassingham, H., Chang-Claude, J., Chanock, S. J., Chen, K., Chiew, Y. E., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Colonna, S., Hansen, T. V. O., Høgdall, E., Høgdall, C. K., Jensen, A., Kjaer, S. K., Nielsen, F. C., GEMO Study Collaborators, GC-HBOC Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, OPAL Study Group, AOCS Group, kConFab Investigators, HEBON Investigators, OCAC Consortium & CIMBA Consortium, 2022, I: European journal of human genetics : EJHG. 30, 3, s. 349-362 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• Targeting the tumor mutanome for personalized vaccination in a TMB low non-small cell lung cancer

  McCann, K., Von Witzleben, A., Thomas, J., Wang, C., Wood, O., Singh, D., Boukas, K., Bendjama, K., Silvestre, N., Nielsen, F. C., Thomas, G., Sanchez-Elsner, T., Greenbaum, J., Schoenberger, S., Peters, B., Vijayanand, P., Savelyeva, N. & Ottensmeier, C., 2022, I: Journal for ImmunoTherapy of Cancer. 10, 3, 14 s., e003821.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  14 Citationer (Scopus)

  9 Downloads (Pure)

• Tumor mutational burden and purity adjustment before and after treatment with temozolomide in 27 paired samples of glioblastoma: a prospective study

  Nørøxe, D. S., Flynn, A., Yde, C. W., Østrup, O., Cilius Nielsen, F., Skjøth-Rasmussen, J., Brennum, J., Hamerlik, P., Weischenfeldt, J., Skovgaard Poulsen, H. & Lassen, U., 2022, I: Molecular Oncology. 16, 1, s. 206-218

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  5 Citationer (Scopus)

  21 Downloads (Pure)
• 2021

  A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers

  GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, kConFab Investigators, HEBON Investigators & ABCTB Investigators, dec. 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 22 s., 1078.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  22 Citationer (Scopus)

  17 Downloads (Pure)

• Achromobacter spp. genetic adaptation in cystic fibrosis

  Gabrielaite, M., Nielsen, F. C., Johansen, H. K. & Marvig, R. L., 2021, I: Microbial genomics. 7, 7, 13 s., 000582.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  10 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

  Gabrielaite, M., Torp, MH., Rasmussen, MS., Andreu-Sánchez, S., Vieira, FG., Pedersen, CB., Kinalis, S., Madsen, MB., Yde, CW., Rønn, O. L., Marvig, RL., Østrup, O., Rossing, C. M., Nielsen, F. C., Winther, O. & Bagger, F. O., 2021, bioRxiv, 29 s.

  Publikation: Working paper › Preprint

  Åben adgang

  Fil
  27 Downloads (Pure)

• A comparison of tools for copy-number variation detection in germline whole exome and whole genome sequencing data

  Gabrielaite, M., Torp, M. H., Rasmussen, M. S., Andreu-Sánchez, S., Vieira, F. G., Pedersen, C. B., Kinalis, S., Madsen, M. B., Kodama, M., Demircan, G. S., Simonyan, A., Yde, C. W., Olsen, L. R., Marvig, R. L., Østrup, O., Rossing, M., Nielsen, F. C., Winther, O. & Bagger, F. O., 2021, I: Cancers. 13, 24, 6283.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  51 Citationer (Scopus)

  34 Downloads (Pure)

• A simple, safe and sensitive method for SARS-CoV-2 inactivation and RNA extraction for RT-qPCR

  Kalnina, L., Mateu-Regué, À., Oerum, S., Hald, A., Gerstoft, J., Oerum, H., Nielsen, F. C. & Iversen, A. K. N., 2021, I: APMIS. 129, 7, s. 393-400 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• Clinical implications of intrinsic molecular subtypes of breast cancer for sentinel node status

  Rossing, M., Pedersen, C. B., Tvedskov, T., Vejborg, I., Talman, M. L., Olsen, L. R., Kroman, N., Nielsen, F. C., Jensen, M. B. & Ejlertsen, B., dec. 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 12 s., 2259.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  14 Citationer (Scopus)

  33 Downloads (Pure)

• Genomic alterations in human papillomavirus-positive and -negative conjunctival squamous cell carcinomas

  Ramberg, I., Vieira, F. G., Toft, P. B., Von Buchwald, C., Funding, M., Nielsen, F. C. & Heegaard, S., 2021, I: Investigative Ophthalmology and Visual Science. 62, 14, 11.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• Major driver mutations are shared between sinonasal intestinal-type adenocarcinoma and the morphologically identical colorectal adenocarcinoma

  Sjöstedt, S., Schmidt, A. Y., Vieira, F. G., Willemoe, G. L., Agander, T. K., Olsen, C., Nielsen, F. C. & von Buchwald, C., apr. 2021, I: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 147, 4, s. 1019-1027 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  15 Citationer (Scopus)

• Transmission and Antibiotic Resistance of Achromobacter in Cystic Fibrosis

  Gabrielaite, M., Bartell, J. A., Nørskov-Lauritsen, N., Pressler, T., Nielsen, F. C., Johansen, H. K. & Marviga, R. L., 2021, I: Journal of Clinical Microbiology. 59, 4, e02911-20.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  37 Citationer (Scopus)

  25 Downloads (Pure)

• Unveiling mRNP composition by fluorescence correlation and cross-correlation spectroscopy using cell lysates

  Mateu-Regué, À., Christiansen, J., Bagger, F. O., Hellriegel, C. & Nielsen, F. C., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 20, 15 s., e119.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  6 Citationer (Scopus)

  17 Downloads (Pure)
• 2020

  Amplicon-Based NGS Panels for Actionable Cancer Target Identification in Follicular Cell-Derived Thyroid Neoplasia

  Madsen, M. B., Kiss, K., Cilius Nielsen, F., Bennedbæk, F. N. & Rossing, M., 2020, I: Frontiers in Endocrinology. 11, 8 s., 146.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  22 Downloads (Pure)

• Association of Genomic Domains in BRCA1 and BRCA2 with Prostate Cancer Risk and Aggressiveness

  Patel, V. L., Busch, E. L., Friebel, T. M., Cronin, A., Leslie, G., McGuffog, L., Adlard, J., Agata, S., Agnarsson, B. A., Ahmed, M., Aittomäki, K., Alducci, E., Andrulis, I. L., Arason, A., Arnold, N., Artioli, G., Arver, B., Auber, B., Azzollini, J., Balmaña, J. & 243 flere, Barkardottir, R. B., Barnes, D. R., Barroso, A., Barrowdale, D., Belotti, M., Benitez, J., Bertelsen, B., Blok, M. J., Bodrogi, I., Bonadona, V., Bonanni, B., Bondavalli, D., Boonen, S. E., Borde, J., Borg, A., Bradbury, A. R., Brady, A., Brewer, C., Brunet, J., Buecher, B., Buys, S. S., Cabezas-Camarero, S., Caldés, T., Caliebe, A., Caligo, M. A., Calvello, M., Campbell, I. G., Carnevali, I., Carrasco, E., Chan, T. L., Chu, A. T. W., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Collaborators, G. S., Collaborators, E., Cook, J., Cortesi, L., Couch, F. J., Daly, M. B., Damante, G., Darder, E., Davidson, R., de la Hoya, M., Puppa, L. D., Dennis, J., Díez, O., Ding, Y. C., Ditsch, N., Domchek, S. M., Donaldson, A., Dworniczak, B., Easton, D. F., Eccles, D. M., Eeles, R. A., Ehrencrona, H., Ejlertsen, B., Engel, C., Evans, D. G., Faivre, L., Faust, U., Feliubadaló, L., Foretova, L., Fostira, F., Fountzilas, G., Frost, D., García-Barberán, V., Garre, P., Gauthier-Villars, M., Géczi, L., Gehrig, A., Gerdes, A-M., Gesta, P., Giannini, G., Glendon, G., Godwin, A. K., Goldgar, D. E., Greene, M. H., Gutierrez-Barrera, A. M., Hahnen, E., Hamann, U., Hauke, J., Herold, N., Hogervorst, F. B. L., Honisch, E., Hopper, J. L., Hulick, P. J., Investigators, KC., Investigators, H., Izatt, L., Jager, A., James, P., Janavicius, R., Jensen, U. B., Jensen, T. D., Johannsson, O. T., John, E. M., Joseph, V., Kang, E., Kast, K., Kiiski, J. I., Kim, S-W., Kim, Z., Ko, K-P., Konstantopoulou, I., Kramer, G., Krogh, L., Kruse, T. A., Kwong, A., Larsen, M., Lasset, C., Lautrup, C., Lazaro, C., Lee, J., Lee, J. W., Lee, M. H., Lemke, J., Lesueur, F., Liljegren, A., Lindblom, A., Llovet, P., Lopez-Fernández, A., Lopez-Perolio, I., Lorca, V., Loud, J. T., Ma, E. S. K., Mai, P. L., Manoukian, S., Mari, V., Martin, L., Matricardi, L., Mebirouk, N., Medici, V., Meijers-Heijboer, H. E. J., Meindl, A., Mensenkamp, A. R., Miller, C., Gomes, D. M., Montagna, M., Mooij, T. M., Moserle, L., Mouret-Fourme, E., Mulligan, A. M., Nathanson, K. L., Navratilova, M., Nevanlinna, H., Niederacher, D., Nielsen, F. C. C., Nikitina-Zake, L., Offit, K., Olah, E., Olopade, O. I., Ong, K-R., Osorio, A., Ott, C-E., Palli, D., Park, S. K., Parsons, M. T., Pedersen, I. S., Peissel, B., Peixoto, A., Pérez-Segura, P., Peterlongo, P., Petersen, A. H., Porteous, M. E., Pujana, M. A., Radice, P., Ramser, J., Rantala, J., Rashid, M. U., Rhiem, K., Rizzolo, P., Robson, M. E., Rookus, M. A., Rossing, C. M., Ruddy, K. J., Santos, C., Saule, C., Scarpitta, R., Schmutzler, R. K., Schuster, H., Senter, L., Seynaeve, C. M., Shah, P. D., Sharma, P., Shin, V. Y., Silvestri, V., Simard, J., Singer, C. F., Skytte, A-B., Snape, K., Solano, A. R., Soucy, P., Southey, M. C., Spurdle, A. B., Steele, L., Steinemann, D., Stoppa-Lyonnet, D., Stradella, A., Sunde, L., Sutter, C., Tan, Y. Y., Teixeira, M. R., Teo, S. H., Thomassen, M., Tibiletti, M. G., Tischkowitz, M., Tognazzo, S., Toland, A. E., Tommasi, S., Torres, D., Toss, A., Trainer, A. H., Tung, N., van Asperen, C. J., van der Baan, F. H., van der Kolk, L. E., van der Luijt, R. B., van Hest, L. P., Varesco, L., Varon-Mateeva, R., Viel, A., Vierstraete, J., Villa, R., von Wachenfeldt, A., Wagner, P., Wang-Gohrke, S., Wappenschmidt, B., Weitzel, J. N., Wieme, G., Yadav, S., Yannoukakos, D., Yoon, S-Y., Zanzottera, C., Zorn, K. K., D'Amico, A. V., Freedman, M. L., Pomerantz, M. M., Chenevix-Trench, G., Antoniou, A. C., Neuhausen, S. L., Ottini, L., Nielsen, H. R. & Rebbeck, T. R., 1 feb. 2020, I: Cancer Research. 80, 3, s. 624-638 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  38 Citationer (Scopus)

• Chromothripsis and DNA Repair Disorders

  Nazaryan-Petersen, L., Bjerregaard, V. A., Nielsen, F. C., Tommerup, N. & Tuemer, Z., 2020, I: Journal of Clinical Medicine. 9, 3, 9 s., 613.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  23 Citationer (Scopus)

  25 Downloads (Pure)

• Cytoplasmic mRNPs revisited: Singletons and condensates

  Mateu-Regue, A., Nielsen, F. C. & Christiansen, J., 2020, I: BioEssays. 42, 12, 13 s., 2000097.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  41 Downloads (Pure)

• Fine-mapping of 150 breast cancer risk regions identifies 191 likely target genes

  Fachal, L., Aschard, H., Beesley, J., Barnes, D. R., Allen, J., Kar, S., Pooley, K. A., Dennis, J., Michailidou, K., Turman, C., Soucy, P., Lemaçon, A., Lush, M., Tyrer, J. P., Ghoussaini, M., Marjaneh, M. M., Jiang, X., Agata, S., Aittomäki, K., Alonso, M. R. & 35 flere, Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antonenkova, N. N., Arason, A., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K., Auber, B., Auer, P. L., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Beeghly-Fadiel, A., Benitez, J., Bermisheva, M., Białkowska, K., Blanco, A. M., Blomqvist, C., Blot, W., Bogdanova, N. V., Bojesen, S. E., Bolla, M. K., Bonanni, B., Borg, A., Bosse, K., Brauch, H., Flyger, H., Nielsen, F. C., Wang, Q., ABCTB Investigators, GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators, kConFab Investigators & HEBON Investigators, 2020, I: Nature Genetics. 52, 1, s. 56-73 18 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  115 Citationer (Scopus)

• Gene loss and acquisition in lineages of pseudomonas aeruginosa evolving in cystic fibrosis patient airways

  Gabrielaite, M., Johansen, H. K., Molin, S., Nielsen, F. C. & Marvig, R. L., 2020, I: mBio. 11, 5, s. 1-16 16 s., e02359-20.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  26 Downloads (Pure)

• Genome-wide association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall and subtype-specific analyses

  Zhang, H., Ahearn, T. U., Lecarpentier, J., Barnes, D., Beesley, J., Qi, G., Jiang, X., O'Mara, T. A., Zhao, N., Bolla, M. K., Dunning, A. M., Dennis, J., Wang, Q., Ful, Z. A., Aittomäki, K., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K. & 31 flere, Auer, P. L., Azzollini, J., Barrowdale, D., Becher, H., Beckmann, M. W., Behrens, S., Benitez, J., Bermisheva, M., Bialkowska, K., Blanco, A., Blomqvist, C., Bogdanova, N. V., Bojesen, S. E., Bonanni, B., Bondavalli, D., Borg, A., Brauch, H., Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brucker, S. Y., Brüning, T., Burwinkel, B., Buys, S. S., Byers, H., Caldés, T., Caligo, M. A., Christiansen, H., Laenkholm, A-V., Nielsen, F. C. & kConFab Investigators, jun. 2020, I: Nature Genetics. 52, 6, s. 572-581 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  264 Citationer (Scopus)

• Genomic profiling of newly diagnosed glioblastoma patients and its potential for clinical utility – a prospective, translational study

  Nørøxe, D. S., Yde, C. W., Østrup, O., Michaelsen, S. R., Schmidt, A. Y., Kinalis, S., Torp, M. H., Skjøth‐Rasmussen, J., Brennum, J., Hamerlik, P., Poulsen, H. S., Nielsen, F. C. & Lassen, U., 2020, I: Molecular Oncology.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  13 Citationer (Scopus)

  36 Downloads (Pure)

• Germline RBBP8 variants associated with early-onset breast cancer compromise replication fork stability

  Zarrizi, R., Higgs, M. R., Voßgröne, K., Rossing, M., Bertelsen, B., Bose, M., Kousholt, A. N., Rösner, H., Network, T. C., Ejlertsen, B., Stewart, G. S., Nielsen, F. C. & Sørensen, C. S., 3 aug. 2020, I: The Journal of Clinical Investigation. 130, 8, s. 4069-4080 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  23 Citationer (Scopus)

  32 Downloads (Pure)

• Polygenic risk scores and breast and epithelial ovarian cancer risks for carriers of BRCA1 and BRCA2 pathogenic variants

  Barnes, D. R., Rookus, M. A., Mcguffog, L., Leslie, G., Mooij, T. M., Dennis, J., Mavaddat, N., Adlard, J., Ahmed, M., Aittomäki, K., Andrieu, N., Andrulis, I. L., Arnold, N., Arun, B. K., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barrowdale, D., Benitez, J., Berthet, P. & 31 flere, Białkowska, K., Blanco, A. M., Blok, M. J., Bonanni, B., Boonen, S. E., Borg, Å., Bozsik, A., Bradbury, A. R., Brennan, P., Brewer, C., Brunet, J., Buys, S. S., Caldés, T., Caligo, M. A., Campbell, I., Christensen, L. L., Chung, W. K., Claes, K. B. M., Colas, C., Collonge-rame, M., Cook, J., Daly, M. B., Davidson, R., De La Hoya, M., De Putter, R., Delnatte, C., Devilee, P., Ejlertsen, B., Gerdes, A., Nielsen, F. C. & Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA and BRCA2, 1 okt. 2020, I: Genetics in Medicine. 22, 10, s. 1653-1666 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  90 Citationer (Scopus)

  12 Downloads (Pure)

• The current epidemic of HPV-associated oropharyngeal cancer: An 18-year Danish population-based study with 2,169 patients

  Zamani, M., Grønhøj, C., Jensen, D. H., Carlander, A. F., Agander, T., Kiss, K., Olsen, C., Baandrup, L., Nielsen, F. C., Andersen, E. V., Friborg, J. & von Buchwald, C., 2020, I: European Journal of Cancer. 134, s. 52-59

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  79 Citationer (Scopus)

  45 Downloads (Pure)

• The Number of Signaling Pathways Altered by Driver Mutations in Chronic Lymphocytic Leukemia Impacts Disease Outcome

  Brieghel, C., da Cunha-Bang, C., Yde, C. W., Schmidt, A. Y., Kinalis, S., Nadeu, F., Andersen, M. A., Jacobsen, L. O., Andersen, M. K., Pedersen, L. B., Delgado, J., Baumann, T., Mattsson, M., Mansouri, L., Rosenquist, R., Campo, E., Nielsen, F. C. & Niemann, C. U., 15 mar. 2020, I: Clinical Cancer Research. 26, 6, s. 1507-1515 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  14 Citationer (Scopus)

• The Spectrum of FANCM Protein Truncating Variants in European Breast Cancer Cases

  Figlioli, G., Kvist, A., Tham, E., Soukupova, J., Kleiblova, P., Muranen, T. A., Andrieu, N., Azzollini, J., Balmaña, J., Barroso, A., Benítez, J., Bertelsen, B., Blanco, A., Bonanni, B., Borg, Å., Brunet, J., Calistri, D., Calvello, M., Chvojka, S., Cortesi, L. & 31 flere, Darder, E., Del Valle, J., Diez, O., Eon-Marchais, S., Fostira, F., Gensini, F., Houdayer, C., Janatova, M., Kiiski, J. I., Konstantopoulou, I., Kubelka-Sabit, K., Lázaro, C., Lesueur, F., Manoukian, S., Marcinkute, R., Mickys, U., Moncoutier, V., Myszka, A., Nguyen-Dumont, T., Nielsen, F. C., Norvilas, R., Olah, E., Osorio, A., Papi, L., Peissel, B., Peixoto, A., Plaseska-Karanfilska, D., Pócza, T., Rossing, M., Rudaitis, V. & ENIGMA Consortium, 2020, I: Cancers. 12, 2, 10 s., 292.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  12 Citationer (Scopus)

  10 Downloads (Pure)

• Transcriptome-wide association study of breast cancer risk by estrogen-receptor status

  Feng, H., Gusev, A., Pasaniuc, B., Wu, L., Long, J., Abu-full, Z., Aittomäki, K., Andrulis, I. L., Anton-Culver, H., Antoniou, A. C., Arason, A., Arndt, V., Aronson, K. J., Arun, B. K., Asseryanis, E., Auer, P. L., Azzollini, J., Balmaña, J., Barkardottir, R. B., Barnes, D. R. & 37 flere, Barrowdale, D., Beckmann, M. W., Behrens, S., Benitez, J., Bermisheva, M., Białkowska, K., Blanco, A., Blomqvist, C., Boeckx, B., Bogdanova, N. V., Bojesen, S. E., Bolla, M. K., Bonanni, B., Borg, A., Brauch, H., Brenner, H., Briceno, I., Broeks, A., Brüning, T., Burwinkel, B., Cai, Q., Caldés, T., Caligo, M. A., Campbell, I., Canisius, S., Christiansen, H., Ejlertsen, B., Flyger, H., Nielsen, F. C., Wang, Q., ABCTB Investigators, HEBON Investigators, BCFR Investigators, OCGN Investigators, GEMO Study Collaborators, EMBRACE Collaborators & GC-HBOC Study Collaborators, 2020, I: Genetic Epidemiology. 44, 5, s. 442-468

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  31 Citationer (Scopus)

  34 Downloads (Pure)

• Tumor miRNA expression profile is related to vestibular schwannoma growth rate

  Sass, H. C. R., Hansen, M., Borup, R., Nielsen, F. C. & Cayé-Thomasen, P., maj 2020, I: Acta Neurochirurgica. 162, 5, s. 1187-1195 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  12 Citationer (Scopus)

• Ultra-fast detection and quantification of nucleic acids by amplification-free fluorescence assay

  Uhd, J., Miotke, L., Ji, H. P., Dunaeva, M., Pruijn, G. J. M., Jørgensen, C. D., Kristoffersen, E. L., Birkedal, V., Yde, C. W., Nielsen, F. C., Hansen, J. & Astakhova, K., 2020, I: Analyst. 145, 17, s. 5836-5844 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  9 Citationer (Scopus)

• Variant in ERAP1 promoter region is associated with low expression in a patient with a Behçet-like MHC-I-opathy

  Dimopoulou, C., Lundgren, J. D., Sundal, J., Ullum, H., Aukrust, P., Nielsen, F. C. & Marvig, R. L., 2020, I: Journal of Human Genetics. 65, 3, s. 325-335 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  6 Citationer (Scopus)
• 2019

  Application of cell-free DNA for genomic tumor profiling: a feasibility study

  Ahlborn, L. B., Rohrberg, K. S., Gabrielaite, M., Tuxen, I. V., Yde, C. W., Spanggaard, I., Santoni-Rugiu, E., Nielsen, F. C., Lassen, U., Mau-Sorensen, M. & Østrup, O., feb. 2019, I: OncoTarget. 10, 14, s. 1388-1398

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  55 Downloads (Pure)

• Cell-free DNA in newly diagnosed patients with glioblastoma - a clinical prospective feasibility study

  Nørøxe, D. S., Østrup, O., Yde, C. W., Ahlborn, L. B., Nielsen, F. C., Michaelsen, S. R., Larsen, V. A., Skjøth-Rasmussen, J., Brennum, J., Hamerlik, P., Poulsen, H. S. & Lassen, U., 2019, I: OncoTarget. 10, 43, s. 4397-4406 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  27 Citationer (Scopus)

  59 Downloads (Pure)

• Completeness of RET testing in patients with medullary thyroid carcinoma in Denmark 1997–2013: A nationwide study

  Danish Thyroid Cancer Group (DATHYRCA), 2019, I: Clinical Epidemiology. 11, s. 93-99 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  8 Citationer (Scopus)

  81 Downloads (Pure)

• Copenhagen prospective personalized oncology (COPPO)—Clinical utility of using molecular profiling to select patients to phase I trials

  Tuxen, I. V., Rohrberg, K. S., Oestrup, O., Ahlborn, L. B., Schmidt, A. Y., Spanggaard, I., Hasselby, J. P., Santoni-Rugiu, E., Yde, C. W., Mau-Sørensen, M., Nielsen, F. C. & Lassen, U., 2019, I: Clinical Cancer Research. 25, 4, s. 1239-1247 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  67 Citationer (Scopus)