Gabriel Renaud

Søgeresultater

• 2024

  100 ancient genomes show repeated population turnovers in Neolithic Denmark

  Allentoft, M. E., Sikora, M., Fischer, A., Sjögren, K-G., Ingason, A., Macleod, R., Rosengren, A., Schulz Paulsson, B., Jørkov, M. L. S., Novosolov, M., Stenderup, J., Price, T. D., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Rasmussen, P., Jensen, T. Z. T., Refoyo-Martínez, A. & 48 flere, Irving-Pease, E. K., Barrie, W., Pearson, A., Sousa da Mota, B., Demeter, F., Henriksen, R. A., Vimala, T., McColl, H., Vaughn, A., Vinner, L., Renaud, G., Stern, A., Johannsen, N. N., Ramsøe, A. D., Schork, A. J., Ruter, A., Gotfredsen, A. B., Nielsen, B. H., Petersen, E. B., Kannegaard, E., Hansen, J., Pedersen, K. B., Pedersen, L., Klassen, L., Meldgaard, M., Johansen, M., Uldum, O. C., Lotz, P., Lysdahl, P., Bangsgaard, P., Petersen, P. V., Maring, R., Iversen, R., Wåhlin, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Lynnerup, N., Lawson, D. J., Rasmussen, S., Korneliussen, T. S., Kjær, K. H., Durbin, R., Nielsen, R., Delaneau, O., Werge, T., Kristiansen, K. & Willerslev, E., 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 329-337 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  14 Citationer (Scopus)

  89 Downloads (Pure)

• Population genomics of post-glacial western Eurasia

  Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., da Mota, B. S., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Jørkov, M. L. S., Demeter, F., Sørensen, L., Nielsen, P. O., Henriksen, R. A., Vimala, T. & 144 flere, McColl, H., Margaryan, A., Ilardo, M., Vaughn, A., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Johannsen, N. N., Rasmussen, P., Vinner, L., Renaud, G., Stern, A., Jensen, T. Z. T., Scorrano, G., Schroeder, H., Lysdahl, P., Ramsøe, A. D., Skorobogatov, A., Schork, A. J., Rosengren, A., Ruter, A., Outram, A., Timoshenko, A. A., Buzhilova, A., Coppa, A., Zubova, A., Silva, A. M., Hansen, A. J., Gromov, A., Logvin, A., Gotfredsen, A. B., Nielsen, B. H., González-Rabanal, B., Lalueza-Fox, C., McKenzie, C. J., Gaunitz, C., Blasco, C., Liesau, C., Martinez-Labarga, C., Pozdnyakov, D. V., Cuenca-Solana, D., Lordkipanidze, D. O., En’shin, D., Salazar-García, D. C., Price, T. D., Borić, D., Kostyleva, E., Veselovskaya, E. V., Usmanova, E. R., Cappellini, E., Petersen, E. B., Kannegaard, E., Radina, F., Yediay, F. E., Duday, H., Gutiérrez-Zugasti, I., Merts, I., Potekhina, I., Shevnina, I., Altinkaya, I., Guilaine, J., Hansen, J., Tortosa, J. E. A., Zilhão, J., Vega, J., Pedersen, K. B., Tunia, K., Zhao, L., Mylnikova, L. N., Larsson, L., Metz, L., Yepiskoposyan, L., Pedersen, L., Sarti, L., Orlando, L., Slimak, L., Klassen, L., Blank, M., González-Morales, M., Silvestrini, M., Vretemark, M., Nesterova, M. S., Rykun, M., Rolfo, M. F., Szmyt, M., Przybyła, M., Calattini, M., Sablin, M., Dobisíková, M., Meldgaard, M., Johansen, M., Berezina, N., Card, N., Saveliev, N. A., Poshekhonova, O., Rickards, O., Lozovskaya, O. V., Gábor, O., Uldum, O. C., Aurino, P., Kosintsev, P., Courtaud, P., Ríos, P., Mortensen, P., Lotz, P., Persson, P., Bangsgaard, P., de Barros Damgaard, P., Vang Petersen, P., Martinez, P. P., Włodarczak, P., Smolyaninov, R. V., Maring, R., Menduiña, R., Badalyan, R., Iversen, R., Turin, R., Vasilyev, S., Wåhlin, S., Borutskaya, S., Skochina, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Serikov, Y. B., Molodin, V. I., Smrcka, V., Merts, V., Appadurai, V., Moiseyev, V., Magnusson, Y., Kjær, K. H., Lynnerup, N., Lawson, D. J., Sudmant, P. H., Rasmussen, S., Korneliussen, T. S., Durbin, R., Nielsen, R., Delaneau, O., Werge, T., Racimo, F., Kristiansen, K. & Willerslev, E., 2024, I: Nature. 625, 7994, s. 301-311

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  27 Citationer (Scopus)

  64 Downloads (Pure)

• soibean: High-Resolution Taxonomic Identification of Ancient Environmental DNA Using Mitochondrial Pangenome Graphs

  Vogel, N. A., Rubin, J. D., Pedersen, A. G., Sackett, P. W., Pedersen, M. W. & Renaud, G., 2024, I: Molecular Biology and Evolution. 41, 10, 15 s., msae203.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
• 2022

  Benchmarking freely available HLA typing algorithms across varying genes, coverages and typing resolutions

  Thuesen, N. H., Klausen, M. S., Gopalakrishnan, S., Trolle, T. & Renaud, G., 2022, I: Frontiers in Immunology. 13, 15 s., 987655.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  11 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• Population Genomics of Stone Age Eurasia

  Allentoft, M. E., Sikora, M., Refoyo-Martínez, A., Irving-Pease, E. K., Fischer, A., Barrie, W., Ingason, A., Stenderup, J., Sjögren, K-G., Pearson, A., Mota, B., Paulsson, B. S., Halgren, A., Macleod, R., Schjellerup Jørkov, M. L., Demeter, F., Novosolov, M., Sørensen, L., Nielsen, P-O., Henriksen, R. H. A. & 143 flere, Vimala, T., McColl, H., Margaryan, A., Ilardo, M., Vaughn, A., Mortensen, M. F., Nielsen, A. B., Hede, M. U., Rasmussen, P., Vinner, L., Renaud, G., Stern, A., Trolle Jensen, T. Z., Johannsen, N. N., Scorrano, G., Schroeder, H., Lysdahl, P., Ramsøe, A. D., Skorobogatov, A., Schork, A. J., Rosengren, A., Ruter, A., Outram, A., Timoshenko, A. A., Buzhilova, A., Coppa, A., Zubova, A., Silva, A. M., Hansen, A. J., Gromov, A., Logvin, A., Gotfredsen, A. B., Nielsen, B. H., González-Rabanal, B., Lalueza-Fox, C., McKenzie, C. J., Gaunitz, C., Blasco, C., Liesau, C., Martinez-Labarga, C., Pozdnyakov, D. V., Cuenca-Solana, D., Lordkipanidze, D. O., En’shin, D., Salazar-García, D. C., Price, T. D., Borić, D., Kostyleva, E., Veselovskaya, E. V., Usmanova, E. R., Cappellini, E., Petersen, E. B., Kannegaard, E., Radina, F., Yediay, F. E., Duday, H., Gutiérrez-Zugasti, I., Potekhina, I., Shevnina, I., Altinkaya, I., Guilaine, J., Hansen, J., Tortosa, J. E. A., Zilhão, J., Vega, J., Pedersen, K. B., Tunia, K., Zhao, L., Mylnikova, L. N., Larsson, L., Metz, L., Yeppiskoposyan, L., Pedersen, L., Sarti, L., Orlando, L., Slimak, L., Klassen, L., Blank, M., González-Morales, M., Silvestrini, M., Vretemark, M., Nesterova, M. S., Rykun, M., Rolfo, M. F., Szmyt, M., Przybyła, M., Calattini, M., Sablin, M., Dobisíková, M., Meldgaard, M., Johansen, M., Berezina, N., Card, N., Saveliev, N. A., Poshekhonova, O., Rickards, O., Lozovskaya, O. V., Uldum, O. C., Aurino, P., Kosintsev, P., Courtaud, P., Ríos, P., Mortensen, P., Lotz, P., Persson, P. Å., Bangsgaard, P., Damgaard, P. D. B., Petersen, P. V., Martinez, P. P., Włodarczak, P., Smolyaninov, R. V., Maring, R., Menduiña, R., Badalyan, R., Iversen, R., Turin, R., Vasilyiev, S., Wåhlin, S., Borutskaya, S., Skochina, S., Sørensen, S. A., Andersen, S. H., Jørgensen, T., Serikov, Y. B., Molodin, V. I., Smrcka, V., Merz, V., Appadurai, V., Moiseyev, V., Magnusson, Y., Kjær, K. H., Lynnerup, N., Lawson, D. J., Sudmant, P. H., Rasmussen, S., Korneliussen, T., Durbin, R., Nielsen, R., Delaneau, O., Werge, T., Racimo, F., Kristiansen, K. & Willerslev, E., 2022, s. 1-71, (bioRxiv).

  Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  Fil
  272 Downloads (Pure)
• 2020

  A likelihood method for estimating present-day human contamination in ancient male samples using low-depth X-chromosome data

  Moreno-Mayar, J. V., Korneliussen, T. S., Dalal, J., Renaud, G., Albrechtsen, A., Nielsen, R. & Malaspinas, A-S., 2020, I: Bioinformatics. 36, 3, s. 828-841 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  11 Citationer (Scopus)

• Population genomics of the Viking world: [incl. correction]

  Margaryan, A., Lawson, D. J., Sikora, M., Racimo, F., Rasmussen, S., Moltke, I., Cassidy, L. M., Jørsboe, E., Ingason, A., Pedersen, M. W., Korneliussen, T., Wilhelmson, H., Buś, M. M., de Barros Damgaard, P., Martiniano, R., Renaud, G., Bhérer, C., Moreno-Mayar, J. V., Fotakis, A. K., Allen, M. & 30 flere, Allmäe, R., Molak, M., Cappellini, E., Scorrano, G., McColl, H., Buzhilova, A., Fox, A., Albrechtsen, A., Schütz, B., Skar, B., Arcini, C., Lundstrøm, I., Cheng, J., Stenderup, J., Iversen, K. H., Arge, S. V., Ellingvåg, S., Orlando, L., Pentz, P., Jessen, M. D., Pedersen, A., Jørkov, M. L., Lynnerup, N., Gilbert, M. T. P., Allentoft, M. E., Sindbæk, S. M., Kristiansen, K., Nielsen, R., Werge, T. & Willerslev, E., 2020, I: Nature. 585, 7825, s. 390-396 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  126 Citationer (Scopus)
• 2019

  Authentication and assessment of contamination in ancient DNA

  Renaud, G., Schubert, M., Sawyer, S. & Orlando, L., 2019, Ancient DNA: Methods and Protocols. Shapiro, B., Barlow, A., Heintzman, P. D., Hofreiter, M., Paijmans, J. L. A. & Soares, A. E. R. (red.). 2. ed. udg. Humana Press, s. 163-194 32 s. (Methods in Molecular Biology, Bind 1963).

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  Fil
  20 Citationer (Scopus)

  524 Downloads (Pure)

• DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

  Hanghøj, K., Renaud, G., Albrechtsen, A. & Orlando, L., 2019, I: GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  15 Citationer (Scopus)

  100 Downloads (Pure)

• Joint Estimates of Heterozygosity and Runs of Homozygosity for Modern and Ancient Samples

  Renaud, G., Hanghøj, K., Korneliussen, T. S., Willerslev, E. & Orlando, L., 2019, I: Genetics (Print). 212, 3, s. 587-614 28 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  43 Citationer (Scopus)

  306 Downloads (Pure)

• The genetic origins of Saint Helena’s liberated Africans

  Sandoval-Velasco, M., Jagadeesan, A., Ávila-Arcos, M. C., Gopalakrishnan, S., Ramos Madrigal, J., Moreno-Mayar, J. V., Renaud, G., Cruz-Dávalos, D. I., Johannesdóttir, E., Watson, J., Robson-Brown, K., Pearson, A., Helgason, A., Gilbert, M. T. P. & Schroeder, H., 2019, bioRxiv, 16 s.

  Publikation: Working paper › Preprint › Forskning

  Fil
  4 Downloads (Pure)

• The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene

  Sikora, M., Pitulko, V. V., Sousa, V. C., Allentoft, M. E., Vinner, L., Rasmussen, S., Margaryan, A., Damgaard, P. D. B., de la Fuente Castro, C., Renaud, G., Yang, M. A., Fu, Q., Dupanloup, I., Giampoudakis, K., Nogues, D. B., Rahbek, C., Kroonen, G., Peyrot, M., McColl, H., Vasilyev, S. V. & 27 flere, Veselovskaya, E., Gerasimova, M., Pavlova, E. Y., Chasnyk, V. G., Nikolskiy, P. A., Gromov, A. V., Khartanovich, V. I., Moiseyev, V., Grebenyuk, P. S., Fedorchenko, A. Y., Lebedintsev, A. I., Slobodin, S. B., Malyarchuk, B. A., Martiniano, R., Meldgaard, M., Arppe, L., Palo, J. U., Sundell, T., Mannermaa, K., Putkonen, M., Alexandersen, V., Primeau, C., Baimukhanov, N., Malhi, R. S., Sjögren, K. G., Nielsen, R. & Willerslev, E., 2019, I: Nature. 570, s. 182–188

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  234 Citationer (Scopus)

  965 Downloads (Pure)

• The repertoire of family A-peptide GPCRs in archaic hominins

  Mata, X., Renaud, G. & Mollereau, C., dec. 2019, I: Peptides. 122, 16 s., 170154.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  11 Downloads (Pure)
• 2018

  137 ancient human genomes from across the Eurasian steppes

  Damgaard, P. D. B., Marchi, N., Rasmussen, S., Peyrot, M., Renaud, G., Korneliussen, T. S., Moreno-Mayar, J. V., Pedersen, M. W., Goldberg, A., Usmanova, E., Baimukhanov, N., Loman, V., Hedeager, L., Pedersen, A. G., Nielsen, K., Afanasievl, G., Akmatov, K., Aldashev, A., Alpaslan, A., Baimbetov, G. & 55 flere, Bazaliiskii, V. I., Beisenov, A., Boldbaatar, B., Boldgiv, B., Dorzhu, C., Ellingvag, S., Erdenebaatar, D., Dajani, R., Dmitriev, E., Evdokimov, V., Frei, K. M., Gromov, A., Goryachev, A., Hakonarson, H., Hegay, T., Khachatryan, Z., Khaskhanov, R., Kitov', E., Kolbina, A., Kubatbek, T., Kukushkin, A., Kukushkin, I., Lau, N., Margaryan, A., Merkyte, I., Mertz, I. V., Mertz, V. K., Mijiddorj, E., Moiyesev, V., Mukhtarova, G., Nurmukhanbetov, B., Orozbekova, Z., Panyushkina, I., Pieta, K., Smrčka, V., Shevnina, I., Logvin, A., Sjögren, K-G., Štolcová, T., Tashbaeva, K., Tkachev, A., Tulegenov, T., Voyakin, D., Yepiskoposyan, L., Undrakhbold, S., Varfolomeev, V., Weber, A., Kradin, N., Allentoft, M. E., Orlando, L. A. A., Nielsen, R., Sikora, M., Heyer, E., Kristiansen, K. & Willerslev, E., 2018, I: Nature. 557, 7705, s. 369-374 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  282 Citationer (Scopus)

• Glactools: a command-line toolset for the management of genotype likelihoods and allele counts

  Renaud, G., 2018, I: Bioinformatics (Online). 34, 8, s. 1398-1400 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  12 Citationer (Scopus)

• Improved de novo genomic assembly for the domestic donkey

  Renaud, G., Petersen, B., Seguin-orlando, A., Bertelsen, M. F., Waller, A., Newton, R., Paillot, R., Bryant, N., Vaudin, M., Librado, P. & Orlando, L., 2018, I: Science Advances. 4, 4, eaaq0392.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  43 Citationer (Scopus)

  106 Downloads (Pure)

• Origins and genetic legacies of the Caribbean Taino

  Schroeder, H., Sikora, M., Gopalakrishnan, S., Cassidy, L. M., Delserc, P. M., Velasco, M. S., Schraiber, J. G., Rasmussen, S., Homburger, J. R., Avila-Arcos, M. C., Allentoft, M. E., Moreno Mayar, J. V., Renaud, G., Gomez-Carballa, A., Laffoon, J. E., Hopkins, R. J. A., Higham, T. F. G., Carr, R. S., Schaffer, W. C., Day, J. S. & 7 flere, Hoogland, M., Salas, A., Bustamante, C. D., Nielsen, R., Bradley, D. G., Hofman, C. L. & Willerslev, E., 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 10, s. 2341-2346 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  57 Citationer (Scopus)

  86 Downloads (Pure)
• 2017

  Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers

  Sikora, M., Seguin-Orlando, A., Sousa, V. C., Albrechtsen, A., Korneliussen, T. S., Ko, A., Rasmussen, S., Dupanloup, I., Nigst, P. R., Bosch, M. D., Renaud, G., Allentoft, M. E., Margaryan, A., Vasilyev, S. V., Veselovskaya, E. V., Borutskaya, S. B., Deviese, T., Comeskey, D., Higham, T., Manica, A. & 7 flere, Foley, R., Meltzer, D. J., Nielsen, R., Excoffler, L., Lahr, M. M., Orlando, L. A. A. & Willerslev, E., 3 nov. 2017, I: Science. 358, 6363, s. 659-662 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  212 Citationer (Scopus)

  140 Downloads (Pure)

• gargammel: a sequence simulator for ancient DNA

  Renaud, G., Hanghøj, K. E., Willerslev, E. & Orlando, L. A. A., 2017, I: Bioinformatics. 33, 4, s. 577-579 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  66 Citationer (Scopus)

  255 Downloads (Pure)