Jakob R. Winther

Publikation

Publikationer pr. år 1985 1996 2001 2007 2014 2018 2021 2024

• 5309 Citationer
• 102 Tidsskriftartikel
• 3 Bidrag til avis - Kronik
• 2 Bidrag til bog/antologi
• 2 Poster
• 5 Mere
  • 2 Kommentar/debat
  • 1 Leder
  • 1 Review
  • 1 Preprint

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2024

  A suicidal and extensively disordered luciferase with a bright luminescence

  Dijkema, F. M., Escarpizo-Lorenzana, M. I., Nordentoft, M. K., Rabe, H. C., Sahin, C., Landreh, M., Branca, R. M., Sørensen, E. S., Christensen, B., Prestel, A., Teilum, K. & Winther, J. R., 2024, I: Protein Science. 33, 8, 16 s., e5115.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Downloads (Pure)
• 2023

  Global analysis of multi-mutants to improve protein function

  Johansson, K. E., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)
• 2022

  Co-evolution of drug resistance and broadened substrate recognition in HIV protease variants isolated from an Escherichia coli genetic selection system

  Koivisto, J. M., Poulsen, N. R., Larsen, B. S., Weibull, M. G. M., Stein, A., Doro, F., Winther, J. R., Lindorff-Larsen, K. & Willemoës, M., 2022, I: The Biochemical journal. 479, 4, s. 479-501

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  1 Citationer (Scopus)

• Engineering Bifidobacterium longum Endo-α-N-acetylgalactosaminidase for Neu5Acα2-3Ga1β1-3Ga1NAc reactivity on Fetuin

  Hansen, D. K., Hansen, A. L., Koivisto, J. M., Shuoker, B., Abou Hachem, M., Winther, J. R. & Willemoës, M., 2022, I: Archives of Biochemistry and Biophysics. 725, 8 s., 109280.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  22 Downloads (Pure)

• Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments

  Norrild, R. K., Johansson, K. E., O'Shea, C., Morth, J. P., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  22 Downloads (Pure)

• The functional role of the autolysis loop in the regulation of factor X upon hemostatic response

  Bonde, A. C., Lund, J., Hansen, J. J., Winther, J. R., Nielsen, P. F., Zahn, S., Tiainen, P., Olsen, O. H., Petersen, H. H. & Rose Bjelke, J., 2022, I: Journal of Thrombosis and Haemostasis. 20, 3, s. 589-599 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)
• 2021

  Charge Engineering Reveals the Roles of Ionizable Side Chains in Electrospray Ionization Mass Spectrometry

  Abramsson, M. L., Sahin, C., Hopper, J. T. S., Branca, R. M. M., Danielsson, J., Xu, M., Chandler, S. A., Österlund, N., Ilag, L. L., Leppert, A., Costeira-Paulo, J., Lang, L., Teilum, K., Laganowsky, A., Benesch, J. L. P., Oliveberg, M., Robinson, C. V., Marklund, E. G., Allison, T. M., Winther, J. R. & 1 flere, Landreh, M., 2021, I: JACS Au. 1, 12, s. 2385-2393 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  15 Citationer (Scopus)

  23 Downloads (Pure)

• Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein

  Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, K. E., Wang, Y., Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, K., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  18 Downloads (Pure)

• Computational and experimental assessment of backbone templates for computational protein design

  Marin, F. I., Johansson, K. E., O’Shea, C., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2021, 15 s.

  Publikation: Working paper › Preprint

  Åben adgang

  Fil
  11 Downloads (Pure)

• Computational and Experimental Assessment of Backbone Templates for Computational Redesign of the Thioredoxin Fold

  Marin, F. I., Johansson, K. E., O'Shea, C., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2021, I: The Journal of Physical Chemistry B. 125, 40, s. 11141-11149

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  4 Citationer (Scopus)

• Flash properties of Gaussia luciferase are the result of covalent inhibition after a limited number of cycles

  Dijkema, F. M., Nordentoft, M. K., Didriksen, A. K., Corneliussen, A. S., Willemoës, M. & Winther, J. R., 2021, I: Protein Science. 30, 3, s. 638-649 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  12 Citationer (Scopus)

• Molekylære stavefejl

  Abildgaard, A. B., Winther, J. R., Lindorff-Larsen, K. & Hartmann-Petersen, R., 28 jan. 2021, I: Weekendavisen, Ideer.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling

• Rational Protein Engineering to Increase the Activity and Stability of IsPETase Using the PROSS Algorithm

  Rennison, A., Winther, J. R. & Varrone, C., 2021, I: Polymers. 13, 22, 11 s., 3884.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  19 Citationer (Scopus)

  15 Downloads (Pure)

• Substitutional landscape of a split fluorescent protein fragment using high-density peptide microarrays

  Antonescu, O. N., Rasmussen, A., Damm, N. A. M., Heidemann, D. F., Popov, R., Nesterov-Mueller, A., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 2, 17 s., e0241461.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  79 Downloads (Pure)

• VM i molekylære puslespil

  Abildgaard, A. B., Winther, J. R., Lindorff-Larsen, K. & Hartmann-Petersen, R., 16 apr. 2021, I: Weekendavisen: Ideer. 15, s. 11

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling

  Fil
• 2020

  Mutations in a Single Signaling Pathway Allow Cell Growth in Heavy Water

  Kampmeyer, C., Johansen, J. V., Holmberg, C., Karlson, M., Gersing, S. K., Bordallo, H. N., Kragelund, B. B., Lerche, M. H., Jourdain, I., Winther, J. R. & Hartmann-Petersen, R., 2020, I: A C S Synthetic Biology. 9, 4, s. 733-748 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  13 Citationer (Scopus)
• 2019

  Improving folding properties of computationally designed proteins

  Bjerre, B., Nissen, J., Madsen, M., Kamarauskaite, J., Norrild, R. K., Holm, P. C., Nordentoft, M. K., O'Shea, C., Willemoës, M., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 13 dec. 2019, I: Protein Engineering Design and Selection (Print). 32, 3, s. 145-151 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  3 Citationer (Scopus)

• Pulmonary effects of nanofibrillated celluloses in mice suggest that carboxylation lowers the inflammatory and acute phase responses

  Hadrup, N., Knudsen, K. B., Berthing, T., Wolff, H., Bengtson, S., Kofoed, C., Espersen, R., Højgaard, C., Winther, J. R., Willemoës, M., Wedin, I., Nuopponen, M., Alenius, H., Norppa, H., Wallin, H. & Vogel, U., 2019, I: Environmental Toxicology and Pharmacology. 66, s. 116-125 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  41 Citationer (Scopus)

• Shining light on split fluorescent protein fitness landscapes using peptide array-based deep substitutional scanning

  ANTONESCU, OANA-NICOLETA., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 30 jun. 2019.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• Steady state kinetic analysis of O-linked GalNAc glycan release catalyzed by endo-α-N-acetylgalactosaminidase

  Hansen, D. K., Winther, J. R. & Willemoës, M., 2019, I: Carbohydrate Research. 480, s. 54-60

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  7 Citationer (Scopus)
• 2018

  A Robust Proton Flux (pHlux) Assay for Studying the Function and Inhibition of the Influenza A M2 Proton Channel

  Santner, P., Martins, J. M. D. S., Laursen, J. S., Behrendt, L., Riber, L., Olsen, C. A., Arkin, I. T., Winther, J. R., Willemoës, M. & Lindorff-Larsen, K., 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5949-5956

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  14 Citationer (Scopus)

• Can a Charged Surfactant Unfold an Uncharged Protein?

  Højgaard, C., Sørensen, H. V., Pedersen, J. S., Winther, J. R. & Otzen, D. E., 2018, I: Biophysical Journal. 115, 11, s. 2081-2086 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  20 Citationer (Scopus)

• Comprehensive mapping of GFP structure-function relationship using high-density peptide arrays

  Antonescu, O-N., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 10 jul. 2018.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• Editorial overview: A perspective on protein evolution

  Hoecker, B. & Winther, J. R., 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. viii-ix 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning › peer review

• Nanofibrillated cellulose causes acute pulmonary inflammation that subsides within a month

  Ilves, M., Vilske, S., Aimonen, K., Lindberg, H. K., Pesonen, S., Wedin, I., Nuopponen, M., Vanhala, E., Højgaard, C., Winther, J. R., Willemoës, M., Vogel, U., Wolff, H., Norppa, H., Savolainen, K. & Alenius, H., 2018, I: Nanotoxicology. 12, 7, s. 729-746 18 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  35 Citationer (Scopus)

• Protein evolution: Hacking an enzyme

  Johansson, K. E. & Winther, J. R., 2018, I: Nature Chemical Biology. 14, 3, s. 202-204 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › peer review

• Random mutagenesis analysis of the Influenza A M2 proton channel reveals novel resistance mutants

  Santner, P., Martins, J. M. D. S., Kampmeyer, C., Hartmann-Petersen, R., Laursen, J. S., Stein, A., Olsen, C. A., Arkin, I. T., Winther, J. R., Willemoës, M. & Lindorff-Larsen, K., 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5957-5968

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  10 Citationer (Scopus)
• 2017

  Endoplasmic reticulum transport of glutathione by Sec61 is regulated by Ero1 and Bip

  Ponsero, A. J., Igbaria, A., Darch, M. A., Miled, S., Outten, C. E., Winther, J. R., Palais, G., D'Autréaux, B., Delaunay-Moisan, A. & Toledano, M. B., 21 sep. 2017, I: Molecular Cell. 67, 6, s. 962-973.e5 18 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  88 Citationer (Scopus)

• Evolution i overhalingsbanen

  Abildgaard, A. B., Hartmann-Petersen, R., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 15 dec. 2017, I: Weekendavisen. 2017, 50, s. Ideer: 13 1 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Bidrag til avis - Kronik › Formidling

  Fil

• Exploring the antigenic response to multiplexed immunizations in a chicken model of antibody production

  Kousted, T. M., Kalliokoski, O., Christensen, S. K., Winther, J. R. & Hau, J., mar. 2017, I: Heliyon. 3, 3, 19 s., e00267.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  174 Downloads (Pure)

• Positive staining for cellulose in oral pulse granuloma

  Virkkunen, S., Wolff, H., Haglund, C., Højgaard, C., Winther, J. R., Willemoës, M., Vogel, U. & Hagström, J., apr. 2017, I: Oral Surgery, Oral Medicine, Oral Pathology and Oral Radiology. 123, 4, s. 464-467 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  4 Citationer (Scopus)
• 2016

  A soluble, folded protein without charged amino acid residues

  Højgaard, C., Kofoed, C., Espersen, R., Johansson, K. E., Villa, M., Willemoës, M., Lindorff-Larsen, K., Teilum, K. & Winther, J. R., 2016, I: Biochemistry. 55, 28, s. 3949–3956 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  323 Downloads (Pure)

• Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template

  Johansson, K. E., Johansen, N. T., Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, J. G., Willemoës, M., Lindorff-Larsen, K., Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, T. W. & Winther, J. R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  257 Downloads (Pure)
• 2015

  Mutational analysis of divalent metal ion binding in the active site of class II α-mannosidase from Sulfolobus solfataricus

  Hansen, D., Webb, H., Nielsen, J. W., Harris, P., Winther, J. R. & Willemoës, M., 2015, I: Biochemistry. 54, 11, s. 2032-2039 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  2 Citationer (Scopus)

• Visualization of nanofibrillar cellulose in biological tissues using a biotinylated carbohydrate binding module of β-1,4-Glycanase

  Knudsen, K. B., Kofoed, C., Espersen, R., Højgaard, C., Winther, J. R., Willemoës, M., Wedin, I., Nuopponen, M., Vilske, S., Aimonen, K., Weydahl, I. E. K., Alenius, H., Norppa, H., Wolff, H., Wallin, E. H. R. & Vogel, U., 2015, I: Chemical Research in Toxicology. 28, 8, s. 1627-1635 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  19 Citationer (Scopus)

  194 Downloads (Pure)
• 2014

  Catalytic site interactions in yeast OMP synthase

  Hansen, M. R., Barr, E. W., Jensen, K. F., Willemoës, M., Grubmeyer, C. & Winther, J. R., 2014, I: Archives of Biochemistry and Biophysics. 542, s. 28-38 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  6 Citationer (Scopus)

• In Silico prediction of mutant HIV-1 proteases cleaving a target sequence

  Jensen, J. H., Willemoës, M., Winther, J. R. & De Vico, L., 2014, I: P L o S One. 9, 5, 11 s., 5.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  11 Citationer (Scopus)

  1668 Downloads (Pure)

• Non-invasive in-cell determination of free cytosolic [NAD+]/[NADH] ratios using hyperpolarized glucose show large variations in metabolic phenotypes

  Christensen, C. E., Karlsson, M., Winther, J. R., Jensen, P. R. & Lerche, M. H., 2014, I: The Journal of Biological Chemistry. 289, 4, s. 2344-2352 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  100 Citationer (Scopus)

• Quantification of thiols and disulfides

  Winther, J. R. & Thorpe, C., 2014, I: BBA General Subjects. 1840, 2, s. 838-846 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  285 Citationer (Scopus)

• Rapid TaqMan-based quantification of chlorophyll d-containing cyanobacteria in the genus Acaryochloris

  Behrendt, L., Nielsen, J. L., Sørensen, S. J., Larkum, A. W. D., Winther, J. R. & Kühl, M., 2014, I: Applied and Environmental Microbiology. 80, 10, s. 3244-3249 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  9 Citationer (Scopus)

• The pK_a value and accessibility of cysteine residues are key determinants for protein substrate discrimination by glutaredoxin

  Jensen, K. S., Pedersen, J. T., Winther, J. R. & Teilum, K., 2014, I: Biochemistry. 53, 15, s. 2533-2540 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  35 Citationer (Scopus)
• 2013

  Intracellular glutathione pools are heterogeneously concentrated

  Montero, D., Tachibana, C., Winther, J. R. & Appenzeller-Herzog, C., 2013, I: Redox Biology. 1, 1, s. 508-513 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  156 Citationer (Scopus)

  173 Downloads (Pure)

• Quantifying changes in the cellular thiol-disulfide status during differentiation of B cells into antibody-secreting plasma cells

  Hansen, R. R. E., Otsu, M., Braakman, I. & Winther, J. R., 2013, I: International Journal of Cell Biology. 2013, 10 s., 898563.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  5 Citationer (Scopus)

• Redox control: a black hole for oxidized glutathione

  Winther, J. R. & Jakob, U., 2013, I: Nature Chemical Biology. 9, 2, s. 69-70 2 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  14 Citationer (Scopus)

• Saccharopepsin

  Winther, J. R., Webb, H. & Kay, J., 2013, Handbook of Proteolytic Enzymes. Rawlings, N. D. & Salvesen, G. (red.). Third Edition udg. Academic Press, Bind 1. s. 128-133 6 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review

  Fil
• 2012

  A fluorescent probe which allows highly specific thiol labeling at low pH

  Nielsen, J. W., Jensen, K. S., Hansen, R. R. E., Gotfredsen, C. H. & Winther, J. R., 2012, I: Analytical Biochemistry. 421, 1, s. 115-120 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  8 Citationer (Scopus)

• Metal-ion dependent catalytic properties of Sulfolobus solfataricus class II α-mannosidase

  Nielsen, J. W., Poulsen, N. R., Johnsson, A. M. S., Winther, J. R., Stipp, S. L. S. & Willemoës, M., 2012, I: Biochemistry. 51, 40, s. 8039-8046 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  6 Citationer (Scopus)

• Polysaccharide effects on calcite growth: the influence of composition and branching

  Nielsen, J. W., Sand, K. K., Pedersen, C. S., Lakshtanov, L. Z., Winther, J. R., Willemoës, M. & Stipp, S. L. S., 2012, I: Crystal Growth & Design. 12, 10, s. 4906-4910 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  32 Citationer (Scopus)

• The human selenoprotein VCP-interacting membrane protein (VIMP) is non-globular and harbors a reductase function in an intrinsically disordered region

  Christensen, L. C., Jensen, N. W., Lages Lino Vala, A., Kamarauskaite, J., Johansson, L. C., Winther, J. R., Hofmann, K., Teilum, K. & Ellgaard, L., 2012, I: Journal of Biological Chemistry. 287, 31, s. 26388-26399 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  42 Citationer (Scopus)
• 2011

  Millisecond dynamics in glutaredoxin during catalytic turnover is dependent on substrate binding and absent in the resting states

  Jensen, K. S., Winther, J. R. & Teilum, K., 2011, I: Journal of the American Chemical Society. 133, 9, s. 3034-42 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  15 Citationer (Scopus)