Personlig profil
Kort præsentation
Beskrivelse af mine forskningsinteresser, aktiviteter og komplette liste af peer reviewed artikler findes på hjemmesiden for Center for non-coding RNA in Technology and Health: http://rth.dk og på forskningsgruppens hjemmeside: http://ivh.ku.dk/bioinformatics.
Samarbejde og topforskningsområder i de sidste fem år
Publikation
-
Exploring the regulatory potential of RNA structures in 202 cyanobacterial genomes
Geissler, A. S., Carrasquer-Alvarez, E., Anthon, C., Frigaard, N.-U., Gorodkin, J. & Seemann, S. E., 2026, I: Nucleic Acids Research. 54, 4, 16 s., gkag081.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil7 Downloads (Pure) -
Light and excessive CO2 uptake inhibit growth of Synechococcus sp. PCC 7002 under very high CO2 levels
Carrasquer-Alvarez, E., Geissler, A. S., Abraham, J. P., Gorodkin, J., Pfleger, B. F., Seemann, S. E. & Frigaard, N. U., 2026, I: Algal Research. 96, 11 s., 104705.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil2 Downloads (Pure) -
Very high CO2 concentrations inhibit photosynthesis and trigger transcriptomic stress responses in cyanobacteria
Geissler, A. S., Carrasquer-Alvarez, E., Gorodkin, J., Frigaard, N.-U. & Seemann, S. E., 2026, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 8, 1, 14 s., lqaf207.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil2 Citationer (Scopus)10 Downloads (Pure) -
An Overview and Comparative Analysis of CRISPR-SpCas9 gRNA Activity Prediction Tools
Yuan, H., Song, C., Xu, H., Sun, Y., Anthon, C., Bolund, L., Lin, L., Benabdellah, K., Lee, C., Hou, Y., Gorodkin, J. & Luo, Y., 2025, I: CRISPR Journal. 8, 2, s. 89-104 16 s.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review
2 Citationer (Scopus) -
Associating cancer-related RNA structure disrupting SNPs in LincRNAs to function
Han, X., Anthon, C., Geissler, A. S., Sabarinathan, R., Seemann, S. E., Havgaard, J. H. & Gorodkin, J., 2025, I: BMC Genomics. 26, 13 s., 1100.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil4 Downloads (Pure) -
Binding and Ligand Activation Driven Enrichment–Directed Evolution of SaCas9 gRNAs Improves Gene Editing Efficiency
Llanga, T., Bush, K., Sun, Y., Yan, A., Zhou, J., Gorodkin, J. & Sullenger, B. A., 2025, I: Nucleic Acid Therapeutics. 35, 5, s. 209-219Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
-
Computational discovery of conserved RNA structures and functional characterization of a structured lncRNA in Leishmania braziliensis
Espada, C. R., Anthon, C., Magalhães, R. D. M., Junior, J. C. Q., Teles, N. M. M., Pais, F. S., Orsine, L. A., de Almeida, L., Defina, T. P. A., Dowle, A., Gorodkin, J., Walrad, P. B. & Cruz, A. K., 2025, I: Non-coding RNA Research. 14, s. 51-64Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil3 Citationer (Scopus)22 Downloads (Pure) -
Deep learning models simultaneously trained on multiple datasets improve base-editing activity prediction
Sun, Y., Qu, K., Corsi, G. I., Anthon, C., Pan, X., Xiang, X., Jensen, L. J., Lin, L., Luo, Y. & Gorodkin, J., 2025, I: Nature Communications. 16, 9 s., 9821.Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
Åben adgangFil1 Citationer (Scopus)6 Downloads (Pure)