A Deep Generative Model for the Inverse Design of Transition Metal Ligands and Complexes

Strandgaard, M., Linjordet, T., Kneiding, H., Burnage, A. L., Nova, A., Jensen, J. H. & Balcells, D., 2025, I: JACS Au. 5, 5, s. 2294–2308 15 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Atom-based machine learning for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and chemical stability

Ree, N., Wollschläger, J. M., Göller, A. H. & Jensen, J. H., 2025, I: Chemical Science. 16, 13, s. 5676-5687 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Enhancing chemical synthesis planning: automated quantummechanics-based regioselectivity prediction for C-Hactivation with directing groups

Seumer, J., Ree, N. & Jensen, J. H., 2025, I: Beilstein Journal of Organic Chemistry. 21, s. 1171-1182 12 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

SMILES all around: structure to SMILES conversion for transition metal complexes

Rasmussen, M. H., Strandgaard, M., Seumer, J., Hemmingsen, L. K., Frei, A., Balcells, D. & Jensen, J. H., 2025, I: Journal of Cheminformatics. 17, 1, 13 s., 63.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The need to implement FAIR principles in biomolecular simulations

Amaro, R. E., Åqvist, J., Bahar, I., Battistini, F., Bellaiche, A., Beltran, D., Biggin, P. C., Bonomi, M., Bowman, G. R., Bryce, R. A., Bussi, G., Carloni, P., Case, D. A., Cavalli, A., Chang, C. E. A., Cheatham, T. E., Cheung, M. S., Chipot, C., Chong, L. T. & Choudhary, P. & 109 flere, Cisneros, G. A., Clementi, C., Collepardo-Guevara, R., Coveney, P., Covino, R., Crawford, T. D., Dal Peraro, M., de Groot, B. L., Delemotte, L., De Vivo, M., Essex, J. W., Fraternali, F., Gao, J., Gelpí, J. L., Gervasio, F. L., González-Nilo, F. D., Grubmüller, H., Guenza, M. G., Guzman, H. V., Harris, S., Head-Gordon, T., Hernandez, R., Hospital, A., Huang, N., Huang, X., Hummer, G., Iglesias-Fernández, J., Jensen, J. H., Jha, S., Jiao, W., Jorgensen, W. L., Kamerlin, S. C. L., Khalid, S., Laughton, C., Levitt, M., Limongelli, V., Lindahl, E., Lindorff-Larsen, K., Loverde, S., Lundborg, M., Luo, Y. L., Luque, F. J., Lynch, C. I., MacKerell, A. D., Magistrato, A., Marrink, S. J., Martin, H., McCammon, J. A., Merz, K., Moliner, V., Mulholland, A. J., Murad, S., Naganathan, A. N., Nangia, S., Noe, F., Noy, A., Oláh, J., O’Mara, M. L., Ondrechen, M. J., Onuchic, J. N., Onufriev, A., Osuna, S., Palermo, G., Panchenko, A. R., Pantano, S., Parish, C., Parrinello, M., Perez, A., Perez-Acle, T., Perilla, J. R., Pettitt, B. M., Pietropaolo, A., Piquemal, J. P., Poma, A. B., Praprotnik, M., Ramos, M. J., Ren, P., Reuter, N., Roitberg, A., Rosta, E., Rovira, C., Roux, B., Rothlisberger, U., Sanbonmatsu, K. Y., Schlick, T., Shaytan, A. K., Simmerling, C., Smith, J. C., Sugita, Y., Świderek, K., Taiji, M., Tao, P., Tieleman, D. P., Tikhonova, I. G., Tirado-Rives, J., Tuñón, I., van der Kamp, M. W., van der Spoel, D., Velankar, S., Voth, G. A., Wade, R., Warshel, A., Welborn, V. V., Wetmore, S. D., Wheeler, T. J., Wong, C. F., Yang, L. W., Zacharias, M. & Orozco, M., 2025, I: Nature Methods. 22, 4, s. 641-645 5 s., 268.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › peer review

Automated quantum chemistry for estimating nucleophilicity and electrophilicity with applications to retrosynthesis and covalent inhibitors

Ree, N., Göller, A. H. & Jensen, J. H., 2024, I: Digital Discovery. 3, 2, s. 347-354 8 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

CACHE Challenge #1: Targeting the WDR Domain of LRRK2, A Parkinson’s Disease Associated Protein

Li, F., Ackloo, S., Arrowsmith, C. H., Ban, F., Barden, C. J., Beck, H., Beránek, J., Berenger, F., Bolotokova, A., Bret, G., Breznik, M., Carosati, E., Chau, I., Chen, Y., Cherkasov, A., Corte, D. D., Denzinger, K., Dong, A., Draga, S. & Dunn, I. & 76 flere, Edfeldt, K., Edwards, A., Eguida, M., Eisenhuth, P., Friedrich, L., Fuerll, A., Gardiner, S. S., Gentile, F., Ghiabi, P., Gibson, E., Glavatskikh, M., Gorgulla, C., Guenther, J., Gunnarsson, A., Gusev, F., Gutkin, E., Halabelian, L., Harding, R. J., Hillisch, A., Hoffer, L., Hogner, A., Houliston, S., Irwin, J. J., Isayev, O., Ivanova, A., Jacquemard, C., Jarrett, A. J., Jensen, J. H., Kireev, D., Kleber, J., Koby, S. B., Koes, D., Kumar, A., Kurnikova, M. G., Kutlushina, A., Lessel, U., Liessmann, F., Liu, S., Lu, W., Meiler, J., Mettu, A., Minibaeva, G., Moretti, R., Morris, C. J., Narangoda, C., Noonan, T., Obendorf, L., Pach, S., Pandit, A., Perveen, S., Poda, G., Polishchuk, P., Puls, K., Pütter, V., Rognan, D., Roskams-Edris, D., Schindler, C., Sindt, F., Spiwok, V., Steinmann, C., Stevens, R. L., Talagayev, V., Tingey, D., Vu, O., Walters, W. P., Wang, X., Wang, Z., Wolber, G., Wolf, C. A., Wortmann, L., Zeng, H., Zepeda, C. A., Zhang, K. Y. J., Zhang, J., Zheng, S. & Schapira, M., 2024, I: Journal of Chemical Information and Modeling. 64, 22, s. 8521-8536 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Discovery of molybdenum based nitrogen fixation catalysts with genetic algorithms

Strandgaard, M., Seumer, J. & Jensen, J. H., 2024, I: Chemical Science. 15, 27, s. 10638–10650 13 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review