Jonas Stenløkke Madsen

Søgeresultater

• 2024

  Flagellar interference with plasmid uptake in biofilms: a joint experimental and modeling study

  Røder, H. L., Christidi, E., Amador, C. I., Music, S., Olesen, A. K., Svensson, B., Madsen, J. S., Herschend, J., Kreft, J-U. & Burmølle, M., 2024, I: Applied and Environmental Microbiology. 90, 1, 15 s., e01510-23.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

• Horizontal transmission of a multidrug-resistant IncN plasmid isolated from urban wastewater

  Yu, Z., Wang, Q., Pinilla-Redondo, R., Madsen, J. S., Clasen, K. A. D., Ananbeh, H., Olesen, A. K., Gong, Z., Yang, N., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, J. & Sørensen, S. J., 2024, I: Ecotoxicology and Environmental Safety. 271, 12 s., 115971.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  24 Downloads (Pure)

• Insights into the circular: The cryptic plasmidome and its derived antibiotic resistome in the urban water systems

  Yu, Z., He, W., Klincke, F., Madsen, J. S., Kot, W., Hansen, L. H., Quintela-Baluja, M., Balboa, S., Dechesne, A., Smets, B., Nesme, J. & Sørensen, S. J., 2024, I: Environment International. 183, 12 s., 108351.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  32 Downloads (Pure)

• Interphylum dissemination of NDM-5-positive plasmids in hospital wastewater from Fuzhou, China: a single-centre, culture-independent, plasmid transmission study

  Yang, Q. E., Ma, X., Zeng, L., Wang, Q., Li, M., Teng, L., He, M., Liu, C., Zhao, M., Wang, M., Hui, D., Madsen, J. S., Liao, H., Walsh, T. R. & Zhou, S., 2024, I: The Lancet Microbe. 5, 1, s. e13-e23 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  19 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• L-asparaginase-driven antibiosis in Pseudomonas fluorescens EK007: A promising biocontrol strategy against fire blight

  Habibi, R., Zibaee, I., Talebi, R., Behravan, J., Tarighi, S., Brejnrod, A., Kjøller, A. H., Sørensen, S. J. & Madsen, J. S., 2024, I: International Journal of Biological Macromolecules. 281, Part 2, 11 s., 136402.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

• Single-cell RNA sequencing reveals plasmid constrains bacterial population heterogeneity and identifies a non-conjugating subpopulation

  Cyriaque, V., Ibarra-Chávez, R., Kuchina, A., Seelig, G., Nesme, J. & Madsen, J. S., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 10 s., 5853.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Downloads (Pure)

• Type IV-A3 CRISPR-Cas systems drive inter-plasmid conflicts by acquiring spacers in trans

  Benz, F., Camara-Wilpert, S., Russel, J., Wandera, K. G., Čepaitė, R., Ares-Arroyo, M., Gomes-Filho, J. V., Englert, F., Kuehn, J. A., Gloor, S., Mestre, M. R., Cuénod, A., Aguilà-Sans, M., Maccario, L., Egli, A., Randau, L., Pausch, P., Rocha, E. P. C., Beisel, C. L., Madsen, J. S. & 4 flere, Bikard, D., Hall, A. R., Sørensen, S. J. & Pinilla-Redondo, R., 2024, I: Cell Host and Microbe. 32, 6, s. 875-886.e9 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  8 Citationer (Scopus)
• 2023

  Associational Resistance to Predation by Protists in a Mixed Species Biofilm

  Goh, Y. F., Røder, H. L., Chan, S. H., Ismail, M. H., Madsen, J. S., Lee, K. W. K., Sørensen, S. J., Givskov, M., Burmølle, M., Rice, S. A. & McDougald, D., 2023, I: Applied and Environmental Microbiology. 89, 2, 16 s., e0174122.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  6 Citationer (Scopus)

  61 Downloads (Pure)

• Bacteriophages suppress CRISPR–Cas immunity using RNA-based anti-CRISPRs

  Camara-Wilpert, S., Mayo-Muñoz, D., Russel, J., Fagerlund, R. D., Madsen, J. S., Fineran, P. C., Sørensen, S. J. & Pinilla-Redondo, R., 2023, I: Nature. 623, 7987, s. 601-607 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  27 Citationer (Scopus)

  27 Downloads (Pure)

• Conjugative plasmids inhibit extracellular electron transfer in Geobacter sulfurreducens

  Fessler, M., Madsen, J. S. & Zhang, Y., 2023, I: Frontiers in Microbiology. 14, 12 s., 1150091.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• Cooperative antibiotic resistance facilitates horizontal gene transfer

  Wang, Q., Wei, S., Silva, A. F. & Madsen, J. S., 2023, I: ISME Journal. 17, 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  14 Citationer (Scopus)

  34 Downloads (Pure)
• 2022

  An easily modifiable conjugative plasmid for studying horizontal gene transfer

  Wang, Q., Olesen, A. K., Maccario, L. & Madsen, J. S., 2022, I: Plasmid. 123-124, 10 s., 102649.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  46 Downloads (Pure)

• CRISPR-Cas systems are widespread accessory elements across bacterial and archaeal plasmids

  Pinilla-Redondo, R., Russel, J., Mayo-Muñoz, D., Shah, S. A., Garrett, R. A., Nesme, J., Madsen, J. S., Fineran, P. C. & Sørensen, S. J., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 8, s. 4315-4328

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  49 Citationer (Scopus)

  71 Downloads (Pure)

• IncHI1A plasmids potentially facilitate horizontal flow of antibiotic resistance genes to pathogens in microbial communities of urban residential sewage

  Olesen, A. K., Pinilla-Redondo, R., Hansen, M. F., Russel, J., Dechesne, A., Smets, B. F., Madsen, J. S., Nesme, J. & Sørensen, S. J., 2022, I: Molecular Ecology. 31, 5, s. 1595-1608

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  11 Citationer (Scopus)

  45 Downloads (Pure)

• Microbial Interactions in Electroactive Biofilms for Environmental Engineering Applications: A Role for Nonexoelectrogens

  Fessler, M., Madsen, J. S. & Zhang, Y., 2022, I: Environmental Science & Technology. 56, 22, s. 15273-15279 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  27 Citationer (Scopus)

  8 Downloads (Pure)

• Unexpected diversity among small-scale sample replicates of defined plant root compartments

  Attia, S., Russel, J., Mortensen, M. S., Madsen, J. S. & Sørensen, S. J., 2022, I: ISME Journal. 16, 4, s. 997-1003 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  33 Citationer (Scopus)

  28 Downloads (Pure)
• 2021

  Biofilms can act as plasmid reserves in the absence of plasmid specific selection

  Røder, H. L., Trivedi, U., Russel, J., Kragh, K. N., Herschend, J., Thalsø-Madsen, I., Tolker-Nielsen, T., Bjarnsholt, T., Burmølle, M. & Madsen, J. S., 2021, I: npj Biofilms and Microbiomes. 7, 6 s., 78.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  79 Downloads (Pure)

• Kin discrimination promotes horizontal gene transfer between unrelated strains in Bacillus subtilis

  Stefanic, P., Belcijan, K., Kraigher, B., Kostanjšek, R., Nesme, J., Madsen, J. S., Kovac, J., Sørensen, S. J., Vos, M. & Mandic-Mulec, I., 2021, I: Nature Communications. 12, 11 s., 3457.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  18 Citationer (Scopus)

  33 Downloads (Pure)

• Lead Drives Complex Dynamics of a Conjugative Plasmid in a Bacterial Community

  Cyriaque, V., Madsen, J. S., Fievez, L., Leroy, B., Hansen, L. H., Bureau, F., Sørensen, S. J. & Wattiez, R., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 14 s., 655903.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  35 Downloads (Pure)
• 2020

  Community-intrinsic properties enhance keratin degradation from bacterial consortia

  Nasipuri, P., Herschend, J., Brejnrod, A. D., Madsen, J. S., Espersen, R., Svensson, B., Burmølle, M., Jacquiod, S. & Sørensen, S. J., 2020, I: PLoS ONE. 15, 1, 26 s., e0228108.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  21 Citationer (Scopus)

  79 Downloads (Pure)

• Horizontal Transfer of Cyclic di-GMP Associated Genes: Theoretical Underpinnings and Future Perspectives

  Madsen, J. S., 2020, Microbial Cyclic Di-Nucleotide Signaling. Chou, S-H., Guiliani, N., Lee, V. T. & Römling, U. (red.). Springer, s. 641-652 12 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review
  1 Citationer (Scopus)

• Persistence and progression of staphylococcal infection in the presence of public goods

  Trivedi, U., Fell, C., Madsen, J. S., Everett, J., Burmølle, M., Rumbaugh, K. P. & Sørensen, S. J., 2020, I: npj Biofilms and Microbiomes. 6, 5 s., 55.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  34 Downloads (Pure)

• Plasmids persist in a microbial community by providing fitness benefit to multiple phylotypes

  Li, L., Dechesne, A., Madsen, J. S., Nesme, J., Sørensen, S. J. & Smets, B. F., 2020, I: I S M E Journal. 14, 5, s. 1170-1181 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  63 Citationer (Scopus)
• 2019

  Fate of CMY-2-Encoding Plasmids Introduced into the Human Fecal Microbiota by Exogenous Escherichia coli

  Anjum, M., Madsen, J. S., Nesme, J., Jana, B., Wiese, M., Jasinskyte, D., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Dalsgaard, A., Moodley, A., Bortolaia, V. & Guardabassi, L., 2019, I: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 5, 13 s., e02528-18.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  19 Citationer (Scopus)

• Fluidic resistance control enables high-throughput establishment of mixed-species biofilms

  Hansen, M. F., Meyer Torp, A., Madsen, J. S., Røder, H. L. & Burmølle, M., 2019, I: BioTechniques. 66, 5, s. 235-239

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  6 Citationer (Scopus)

  134 Downloads (Pure)

• Interspecies interactions reduce selection for a biofilm-optimized variant in a four-species biofilm model

  Røder, H. L., Liu, W., Sørensen, S. J., Madsen, J. S. & Burmølle, M., 2019, I: Environmental Microbiology Reports. 11, 6, s. 835-839 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  11 Citationer (Scopus)

• Priority of Early Colonizers but No Effect on Cohabitants in a Synergistic Biofilm Community

  Olsen, N. M. C., Røder, H. L., Russel, J., Madsen, J. S., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 2019, I: Frontiers in Microbiology. 10, 8 s., 1949.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  12 Citationer (Scopus)

  119 Downloads (Pure)
• 2018

  A culture-independent method for studying transfer of IncI1 plasmids from wild-type Escherichia coli in complex microbial communities

  Anjum, M., Madsen, J. S., Espinosa-Gongora, C., Jana, B., Wiese, M., Nielsen, D. S., Sørensen, S. J., Moodley, A., Bortolaia, V. & Guardabassi, L., sep. 2018, I: Journal of Microbiological Methods. 152, s. 18-26 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  7 Citationer (Scopus)

• An intriguing relationship between the cyclic diguanylate signaling system and horizontal gene transfer

  Madsen, J. S., Hylling, O., Jacquiod, S. J. A., Pécastaings, S., Hansen, L. H., Riber, L., Vestergaard, G. A. & Sørensen, S. J., 2018, I: ISME Journal. 12, 9, s. 2330-2334 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  19 Citationer (Scopus)

• Bacterial social interactions and the emergence of community-intrinsic properties

  Madsen, J. S., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 2018, I: Current Opinion in Microbiology. 42, s. 104-109 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  65 Citationer (Scopus)

• Enhanced bacterial mutualism through an evolved biofilm phenotype

  Røder, H. L., Herschend, J., Russel, J., Andersen, M. F., Madsen, J. S., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 1 nov. 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 2608-2618 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  34 Citationer (Scopus)

• Estimating the Transfer Range of Plasmids Encoding Antimicrobial Resistance in a Wastewater Treatment Plant Microbial Community

  Li, L., Dechesne, A., He, Z., Madsen, J. S., Nesme, J., Sørensen, S. J. & Smets, B. F., 8 maj 2018, I: Environmental Science & Technology Letters. 5, 5, s. 260-265 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review
  92 Citationer (Scopus)

• Micro-scale intermixing: a requisite for stable and synergistic co-establishment in a four-species biofilm

  Liu, W., Russel, J., Burmølle, M., Sørensen, S. J. & Madsen, J. S., 2018, I: I S M E Journal. 12, s. 1940-1951 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  34 Citationer (Scopus)

• Staphylococcus aureus coagulases are exploitable yet stable public goods in clinically relevant conditions

  Trivedi, U., Madsen, J. S., Everett, J., Fell, C., Russel, J., Haaber, J., Crosby, H. A., Horswill, A. R., Burmølle, M., Rumbaugh, K. P. & Sørensen, S. J., 11 dec. 2018, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 50, s. E11771-E11779

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  14 Citationer (Scopus)
• 2017

  Antagonism correlates with metabolic similarity in diverse bacteria

  Russel, J., Røder, H. L., Madsen, J. S., Burmølle, M. & Sørensen, S. J., 3 okt. 2017, I: Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America. 114, 40, s. 10684-10688 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  112 Citationer (Scopus)

• A post-planktonic era of in vitro infectious models: issues and changes addressed by a clinically relevant wound like media

  Trivedi, U., Madsen, J. S., Rumbaugh, K. P., Wolcott, R. D., Burmølle, M. & Sørensen, S. J., 2017, I: Critical Reviews in Microbiology. 43, 4, s. 453-465 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  18 Citationer (Scopus)

• Low-abundant species facilitates specific spatial organization that promotes multispecies biofilm formation

  Liu, W., Russel, J., Røder, H. L., Madsen, J. S., Burmølle, M. & Sørensen, S. J., 2017, I: Environmental Microbiology. 19, 7, s. 2893-2905 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  54 Citationer (Scopus)

• Whole-genome sequence of Pseudomonas fluorescens EK007-RG4, a promising biocontrol agent against a broad range of bacteria, including the fire blight bacterium Erwinia amylovora

  Habibi, R., Tarighi, S., Behravan, J., Taheri, P., Kjøller, A. H., Brejnrod, A. D., Madsen, J. S. & Sørensen, S. J., 2017, I: Genome Announcements. 5, 13, 2 s., e00026-17.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  316 Downloads (Pure)
• 2016

  Coexistence facilitates interspecific biofilm formation in complex microbial communities

  Madsen, J. S., Røder, H. L., Russel, J., Sørensen, H., Burmølle, M. & Sørensen, S. J., 2016, I: Environmental Microbiology. 18, 8, s. 2565–2574

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  95 Citationer (Scopus)

• Interspecific bacterial interactions are reflected in multispecies biofilm spatial organization

  Liu, W., Røder, H. L., Madsen, J. S., Bjarnsholt, T., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 2016, I: Frontiers in Microbiology. 7, 8 s., 1366.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  142 Citationer (Scopus)

  422 Downloads (Pure)

• Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer

  Madsen, J. S., Riber, L., Kot, W. P., Basfeld, A., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  312 Downloads (Pure)
• 2015

  Facultative control of matrix production optimizes competitive fitness in Pseudomonas aeruginosa PA14 biofilm models

  Madsen, J. S., Lin, Y. C., Squyres, G. R., Price-Whelan, A., Torio, A. D. S., Song, A., Cornell, W. C., Sørensen, S. J., Xavier, J. B. & Dietrich, L. E. P., 2015, I: Applied and Environmental Microbiology. 81, 24, s. 8414-8426 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  56 Citationer (Scopus)

• High prevalence of biofilm synergy among bacterial soil isolates in cocultures indicates bacterial interspecific cooperation

  Ren, D., Madsen, J. S., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 11 jan. 2015, I: ISME Journal. 9, s. 81-89 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  228 Citationer (Scopus)

• Presence of Pathogenic bacteria and viruses in the daycare environment

  Ibfelt, T., Engelund, E. H., Permin, A., Madsen, J. S., Schultz, A. C. & Andersen, L. P., 2015, I: Journal of Environmental Health. 78, 3, s. 24-29 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  11 Citationer (Scopus)
• 2014

  High-throughput screening of multispecies biofilm formation and quantitative PCR-based assessment of individual species proportions, useful for exploring interspecific bacterial interactions

  Ren, D., Madsen, J. S., de la Cruz Perera, C. I., Bergmark, L., Sørensen, S. J. & Burmølle, M., 2014, I: Microbial Ecology. 68, 1, s. 146-154 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  81 Citationer (Scopus)

• Sociomicrobiology: Bacterial Interactions and Biofilm Formation

  Madsen, J. S., 2014, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 165 s.

  Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

  Fil
• 2013

  A spatiotemporal view of plasmid loss in biofilms and planktonic cultures: [plus] Erratum

  Madsen, J. S., Burmølle, M. & Sørensen, S. J., 2013, I: Biotechnology and Bioengineering (Print). 110, 12, s. 3071-3074 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  8 Citationer (Scopus)
• 2012

  The interconnection between biofilm formation and horizontal gene transfer

  Madsen, J. S., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012, I: F E M S Immunology and Medical Microbiology. 65, 2, s. 183-195 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  482 Citationer (Scopus)

• When it makes sense to socialize whilst being on the move: A small EAL-domain containing protein, encoded on natural biofilm-promoting plasmids, triggers motility

  Madsen, J. S., Riber, L., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
• 2011

  Characterization of pIC13_78, a biofilm enabling plasmid

  Madsen, J. S., Norman, A., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2011.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning