Juan Antonio Rodríguez

Søgeresultater

• 2024

  Three-dimensional genome architecture persists in a 52,000-year-old woolly mammoth skin sample

  Sandoval-Velasco, M., Dudchenko, O., Rodríguez, J. A., Estrada, C. P., Dehasque, M., Fontsere, C., Mak, S. S. T., Khan, R., Contessoto, V. G., Oliveira Junior, A. B., Kalluchi, A., Herrera, B. J. Z., Jeong, J., Roy, R. P., Christopher, I., Weisz, D., Omer, A. D., Batra, S. S., Shamim, M. S., Durand, N. C. & 36 flere, O'Connell, B., Roca, A. L., Plikus, M. V., Kusliy, M. A., Romanenko, S. A., Lemskaya, N. A., Serdyukova, N. A., Modina, S. A., Perelman, P. L., Kizilova, E. A., Baiborodin, S. I., Rubtsov, N. B., Machol, G., Rath, K., Mahajan, R., Kaur, P., Gnirke, A., Garcia-Treviño, I., Coke, R., Flanagan, J. P., Pletch, K., Ruiz-Herrera, A., Plotnikov, V., Pavlov, I. S., Pavlova, N. I., Protopopov, A. V., Di Pierro, M., Graphodatsky, A. S., Lander, E. S., Rowley, M. J., Wolynes, P. G., Onuchic, J. N., Dalén, L., Marti-Renom, M. A., Gilbert, M. T. P. & Aiden, E. L., 2024, I: Cell. 187, 14, s. 3541-3562.e51 74 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)
• 2021

  A multilayered post-GWAS assessment on genetic susceptibility to pancreatic cancer

  López de Maturana, E., Rodríguez, J. A., Alonso, L., Lao, O., Molina-Montes, E., Martín-Antoniano, I. A., Gómez-Rubio, P., Lawlor, R., Carrato, A., Hidalgo, M., Iglesias, M., Molero, X., Löhr, M., Michalski, C., Perea, J., O’Rorke, M., Barberà, V. M., Tardón, A., Farré, A., Muñoz-Bellvís, L. & 32 flere, Crnogorac-Jurcevic, T., Domínguez-Muñoz, E., Gress, T., Greenhalf, W., Sharp, L., Arnes, L., Cecchini, L., Balsells, J., Costello, E., Ilzarbe, L., Kleeff, J., Kong, B., Márquez, M., Mora, J., O’Driscoll, D., Scarpa, A., Ye, W., Yu, J., García-Closas, M., Kogevinas, M., Rothman, N., Silverman, D. T., Albanes, D., Arslan, A. A., Beane-Freeman, L., Bracci, P. M., Brennan, P., Bueno-de-Mesquita, B., Buring, J., Canzian, F., PanGenEU Investigators & SBC/EPICURO Investigators, 2021, I: Genome Medicine. 13, 1, 18 s., 15.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  17 Citationer (Scopus)

  26 Downloads (Pure)

• DeepCOMBI: explainable artificial intelligence for the analysis and discovery in genome-wide association studies

  Mieth, B., Rozier, A., Rodriguez, J. A., Höhne, M. M. C., Görnitz, N. & Müller, K-R., 2021, I: NAR Genomics and Bioinformatics. 3, 3, 21 s., lqab065.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  23 Citationer (Scopus)

  7 Downloads (Pure)

• STAG2 loss-of-function affects short-range genomic contacts and modulates the basal-luminal transcriptional program of bladder cancer cells

  Richart, L., Lapi, E., Pancaldi, V., Cuenca-Ardura, M., Pau, E. C-D-S., Madrid-Mencía, M., Neyret-Kahn, H., Radvanyi, F., Rodríguez, J. A., Cuartero, Y., Serra, F., Le Dily, F., Valencia, A., Marti-Renom, M. A. & Real, F. X., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 19, s. 11005-11021 17 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  17 Citationer (Scopus)

  7 Downloads (Pure)
• 2020

  Hi-C chromosome conformation capture sequencing of avian genomes using the BGISEQ-500 platform

  Sandoval-Velasco, M., Antonio Rodriguez, J., Estrada, C. P., Zhang, G., Aiden, E. L., Marti-Renom, M. A., Gilbert, M. T. P. & Smith, O., 2020, I: GigaScience. 9, 8, 7 s., giaa087.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  35 Downloads (Pure)
• 2018

  Biological Processes Modulating Longevity across Primates: A Phylogenetic Genome-Phenome Analysis

  Muntané, G., Farré, X., Rodriguez, J. A., Pegueroles, C., Hughes, D. A., de Magalhães, J. P., Gabaldón, T. & Navarro, A., 2018, I: Molecular Biology and Evolution. 35, 8, s. 1990-2004 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  51 Citationer (Scopus)

  7 Downloads (Pure)

• Replicability and Prediction: Lessons and Challenges from GWAS

  Marigorta, U. M., Rodríguez, J. A., Gibson, G. & Navarro, A., 2018, I: Trends in Genetics. 34, 7, s. 504-517 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  115 Citationer (Scopus)
• 2017

  Antagonistic pleiotropy and mutation accumulation influence human senescence and disease

  Rodríguez, J. A., Marigorta, U. M., Hughes, D. A., Spataro, N., Bosch, E. & Navarro, A., 2017, I: Nature Ecology and Evolution. 1, 3, 5 s., 0055.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  68 Citationer (Scopus)

• Discovering the 3' UTR-mediated regulation of alpha-synuclein

  Marchese, D., Botta-Orfila, T., Cirillo, D., Rodriguez, J. A., Livi, C. M., Fernández-Santiago, R., Ezquerra, M., Martí, M. J., Bechara, E. & Tartaglia, G. G., 2017, I: Nucleic Acids Research. 45, 22, s. 12888-12903 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  6 Downloads (Pure)

• Genetic factors affecting EBV copy number in lymphoblastoid cell lines derived from the 1000 Genome Project samples

  Mandage, R., Telford, M., Rodríguez, J. A., Farré, X., Layouni, H., Marigorta, U. M., Cundiff, C., Heredia-Genestar, J. M., Navarro, A. & Santpere, G., 2017, I: PLoS ONE. 12, 6, 19 s., e0179446.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  20 Citationer (Scopus)

  4 Downloads (Pure)

• Properties of human disease genes and the role of genes linked to Mendelian disorders in complex disease aetiology

  Spataro, N., Rodríguez, J. A., Navarro, A. & Bosch, E., 2017, I: Human Molecular Genetics. 26, 3, s. 489-500 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  32 Citationer (Scopus)

  4 Downloads (Pure)
• 2016

  267 Spanish Exomes Reveal Population-Specific Differences in Disease-Related Genetic Variation

  Dopazo, J., Amadoz, A., Bleda, M., Garcia-Alonso, L., Alemán, A., García-García, F., Rodriguez, J. A., Daub, J. T., Muntané, G., Rueda, A., Vela-Boza, A., López-Domingo, F. J., Florido, J. P., Arce, P., Ruiz-Ferrer, M., Méndez-Vidal, C., Arnold, T. E., Spleiss, O., Alvarez-Tejado, M., Navarro, A. & 4 flere, Bhattacharya, S. S., Borrego, S., Santoyo-López, J. & Antiñolo, G., 2016, I: Molecular Biology and Evolution. 33, 5, s. 1205-1218 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  59 Citationer (Scopus)

  7 Downloads (Pure)

• Combining Multiple Hypothesis Testing with Machine Learning Increases the Statistical Power of Genome-wide Association Studies

  Mieth, B., Kloft, M., Rodríguez, J. A., Sonnenburg, S., Vobruba, R., Morcillo-Suárez, C., Farré, X., Marigorta, U. M., Fehr, E., Dickhaus, T., Blanchard, G., Schunk, D., Navarro, A. & Müller, K-R., 2016, I: Scientific Reports. 6, 14 s., 36671.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  55 Citationer (Scopus)

  4 Downloads (Pure)
• 2014

  Genomic analysis of the blood attributed to Louis XVI (1754-1793), king of France

  Olalde, I., Sánchez-Quinto, F., Datta, D., Marigorta, U. M., Chiang, C. W. K., Rodríguez, J. A., Fernández-Callejo, M., González, I., Montfort, M., Matas-Lalueza, L., Civit, S., Luiselli, D., Charlier, P., Pettener, D., Ramírez, O., Navarro, A., Himmelbauer, H., Marquès-Bonet, T. & Lalueza-Fox, C., 2014, I: Scientific Reports. 4, 7 s., 4666.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  15 Citationer (Scopus)

  5 Downloads (Pure)