Circular RNA expression landscapes in myelodysplastic neoplasms: Associations with mutational signatures and disease progression

Wedge, E., Tulstrup, M., Todisco, G., Moura, P., Côme, C., Hansen, J. W., Jespersen, J. S., Schlotmann, B., Creignou, M., Dahl, M., Schöllkopf, C., Raaschou-Jensen, K., Wennerberg, K., Porse, B., Weischenfeldt, J., Hellstrom-Lindberg, E., Kristensen, L. S. & Gronbaek, K., 19 feb. 2026, (E-pub ahead of print) I: Molecular Oncology. 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

A Comparative Study of Bone Marrow and Central Nervous System Microenvironment Models to Improve In Vitro Studies of Acute Lymphoblastic Leukemia

Kiørboe, K. J., Akoto, J. S., Nørgaard, M. J., Overgaard, M., Niora, M., Wennerberg, K., Schmiegelow, K. & Thastrup, M., 2025, I: Hematological Oncology. 43, 4, 10 s., e70108.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

A Machine Learning-Based Strategy Predicts Selective and Synergistic Drug Combinations for Relapsed Acute Myeloid Leukemia

Chen, Y., He, L., Ianevski, A., Nader, K., Ruokoranta, T., Linnavirta, N., Miettinen, J. J., Vähä-Koskela, M., Vänttinen, I., Kuusanmäki, H., Kontro, M., Porkka, K., Wennerberg, K., Heckman, C. A., Giri, A. K. & Aittokallio, T., 2025, I: Cancer Research. 85, 14, s. 2753-2768 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Computational drug repurposing: approaches, evaluation of in silico resources and case studies

Tanoli, Z., Fernández-Torras, A., Özcan, U. O., Kushnir, A., Nader, K. M., Gadiya, Y., Fiorenza, L., Ianevski, A., Vähä-Koskela, M., Miihkinen, M., Seemab, U., Leinonen, H., Seashore-Ludlow, B., Tampere, M., Kalman, A., Ballante, F., Benfenati, E., Saunders, G., Potdar, S. & Gómez García, I. & 23 flere, García-Serna, R., Talarico, C., Beccari, A. R., Schaal, W., Polo, A., Costantini, S., Cabri, E., Jacobs, M., Saarela, J., Budillon, A., Spjuth, O., Östling, P., Xhaard, H., Quintana, J., Mestres, J., Gribbon, P., Ussi, A. E., Lo, D. C., de Kort, M., Wennerberg, K., Fratelli, M., Carreras-Puigvert, J. & Aittokallio, T., 2025, I: Nature Reviews Drug Discovery. 24, 7, s. 521–542

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › peer review

Decoding the Genomic and Functional Landscape of Emerging Subtypes in Ovarian Cancer

Micoli, G., Lavikka, K., Li, Y., Pirttikoski, A., Afenteva, D., Senkowski, W., Marchi, G., Vähärautio, A., Muranen, T. A., Joutsiniemi, T., Hietanen, S., Virtanen, A., Wennerberg, K., Hynninen, J., Oikkonen, J. & Hautaniemi, S., 2025, I: Cancer Discovery. 15, 11, s. 2262-2277 16 s.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

DEK::NUP214 acts as an XPO1-dependent transcriptional activator of essential leukemia genes

Kaya, F., Bewicke-Copley, F., Miettinen, J. J., Casado, P., Leddy, E., Deniz, Ö., Lavallée, V. P., Philippe, C., Zheng, J., Grebien, F., Khan, N., Krizsán, S., Saad, J., Nolin-Lapalme, A., Hébert, J., Lemieux, S., Audemard, E., Matthews, J., Grantham, M. & Di Bella, D. & 17 flere, Wennerberg, K., Parsons, A., Gribben, J., Cavenagh, J. D., Freeman, S. D., Bödör, C., Sauvageau, G., Wang, J., Llamas-Sillero, P., Cazier, J. B., Taussig, D. C., Bonnet, D., Cutillas, P. R., Heckman, C. A., Fitzgibbon, J., Rouault-Pierre, K. & Rio-Machin, A., 2025, I: Leukemia. 39, 6, 6 s., 440.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › peer review

Ex vivo venetoclax sensitivity predicts clinical response in acute myeloid leukemia in the prospective VenEx trial

Kytölä, S., Vänttinen, I., Ruokoranta, T., Partanen, A., Holopainen, A., Saad, J., Kuusisto, M. E. L., Koskela, S., Räty, R., Itälä-Remes, M., Västrik, I., Suvela, M., Parsons, A., Porkka, K., Wennerberg, K., Heckman, C. A., Jalkanen, T., Huttunen, T., Ettala, P. & Rimpiläinen, J. & 4 flere, Siitonen, T., Pyörälä, M., Kuusanmäki, H. & Kontro, M., 2025, I: Blood. 145, 4, s. 409-421

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

A synthetic lethal dependency on casein kinase 2 in response to replication-perturbing therapeutics in RB1-deficient cancer cells

Bulanova, D., Akimov, Y., Senkowski, W., Oikkonen, J., Gall-Mas, L., Timonen, S., Elmadani, M., Hynninen, J., Hautaniemi, S., Aittokallio, T. & Wennerberg, K., 2024, I: Science Advances. 10, 21, 15 s., eadj1564.

Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review