Kristian Ebbesen Hanghøj

Søgeresultater

• 2024

  African bushpigs exhibit porous species boundaries and appeared in Madagascar concurrently with human arrival

  Balboa, R. F., Bertola, L. D., Brüniche-Olsen, A., Rasmussen, M. S., Liu, X., Besnard, G., Salmona, J., Santander, C. G., He, S., Zinner, D., Pedrono, M., Muwanika, V., Masembe, C., Schubert, M., Kuja, J., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Stæger, F. F., Rakotoarivony, R., Henrique, M. & 14 flere, Lin, L., Wang, X., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Hanghøj, K., Sinding, M. H. S., Atickem, A., Chikhi, L., Roos, C., Gaubert, P., Siegismund, H. R., Moltke, I., Albrechtsen, A. & Heller, R., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 15 s., 172.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  41 Downloads (Pure)

• Analysis of admixed Greenlandic siblings shows that the mean genotypic values for metabolic phenotypes differ between Inuit and Europeans

  Lin, L., Andersen, M. K., Stæger, F. F., Li, Z., Hanghøj, K., Linneberg, A., Grarup, N., Jørgensen, M. E., Hansen, T., Moltke, I. & Albrechtsen, A., 2024, I: Genome Medicine. 16, 14 s., 71.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  20 Downloads (Pure)

• Extensive Population Structure Highlights an Apparent Paradox of Stasis in the Impala (Aepyceros melampus)

  Garcia-Erill, G., Wang, X., Rasmussen, MS., Quinn, L., Khan, A., Bertola, LD., Santander, CG., Balboa, RF., Ogutu, JO., Pečnerová, P., Hanghøj, K., Kuja, J., Nursyifa, C., Masembe, C., Muwanika, V., Bibi, F., Moltke, I., Siegismund, HR., Albrechtsen, A. & Heller, R., 2024, I: Molecular Ecology. 33, 22, 17 s., e17539.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Downloads (Pure)

• Giraffe lineages are shaped by major ancient admixture events

  Bertola, L. D., Quinn, L., Hanghøj, K., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Balboa, R. F., Meisner, J., Bøggild, T., Wang, X., Lin, L., Nursyifa, C., Liu, X., Li, Z., Chege, M., Moodley, Y., Brüniche-Olsen, A., Kuja, J., Schubert, M., Agaba, M., Santander, C. G. & 7 flere, Sinding, M. H. S., Muwanika, V., Masembe, C., Siegismund, H. R., Moltke, I., Albrechtsen, A. & Heller, R., 2024, I: Current Biology. 34, 7, s. 1576-1586.e5 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  5 Citationer (Scopus)

  14 Downloads (Pure)

• Gut heavy metal and antibiotic resistome of humans living in the high Arctic

  Hauptmann, A. L., Johansen, J., Stæger, F. F., Nielsen, D. S., Mulvad, G., Hanghøj, K., Rasmussen, S., Hansen, T. & Albrechtsen, A., 2024, I: Frontiers in Microbiology. 15, 15 s., 1493803.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Downloads (Pure)

• Introgression and disruption of migration routes have shaped the genetic integrity of wildebeest populations

  Liu, X., Lin, L., Sinding, M. H. S., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Quinn, L., Garcia-Erill, G., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Pečnerová, P., Balboa, R. F., Li, Z., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pinto, R. R., Wang, X., Kuja, J., Brüniche-Olsen, A., Meisner, J., Santander, C. G. & 8 flere, Ogutu, J. O., Masembe, C., da Fonseca, R. R., Muwanika, V., Siegismund, H. R., Albrechtsen, A., Moltke, I. & Heller, R., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 16 s., 2921.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  18 Downloads (Pure)

• Persistent Gene Flow Suggests an Absence of Reproductive Isolation in an African Antelope Speciation Model

  Wang, X., Pedersen, C-E. T., Athanasiadis, G., Garcia-Erill, G., Hanghøj, K., Bertola, L. D., Rasmussen, M. S., Schubert, M., Liu, X., Li, Z., Lin, L., Balboa, R. F., Jørsboe, E., Nursyifa, C., Liu, S., Muwanika, V., Masembe, C., Chen, L., Wang, W., Moltke, I. & 3 flere, Siegismund, H. R., Albrechtsen, A. & Heller, R., 2024, I: Systematic Biology. 73, 6, s. 979–994 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  2 Downloads (Pure)

• Population genomics of the muskox' resilience in the near absence of genetic variation

  Pečnerová, P., Lord, E., Garcia-Erill, G., Hanghøj, K., Rasmussen, M. S., Meisner, J., Liu, X., van der Valk, T., Santander, C. G., Quinn, L., Lin, L., Liu, S., Carøe, C., Dalerum, F., Götherström, A., Måsviken, J., Vartanyan, S., Raundrup, K., Al-Chaer, A., Rasmussen, L. & 11 flere, Hvilsom, C., Heide-Jørgensen, M. P., Sinding, M. H. S., Aastrup, P., Van Coeverden de Groot, P. J., Schmidt, N. M., Albrechtsen, A., Dalén, L., Heller, R., Moltke, I. & Siegismund, H. R., 2024, I: Molecular Ecology. 33, 2, 25 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  7 Citationer (Scopus)

• Skeletal muscle from TBC1D4 p.Arg684Ter variant carriers is severely insulin resistant but exhibits normal metabolic responses during exercise

  Kristensen, J. M., Kjøbsted, R., Larsen, T. J., Carl, C. S., Hingst, J. R., Onslev, J., Birk, J. B., Thorup, A., Steenberg, D. E., Knudsen, J. R., Henriksen, N. S., Needham, E. J., Halling, J. F., Gudiksen, A., Rundsten, C. F., Hanghøj, K. E., Stinson, S. E., Hoier, B., Hansen, C. C., Jensen, T. E. & 11 flere, Hellsten, Y., Pilegaard, H., Grarup, N., Olesen, J., Humphrey, S. J., James, D. E., Pedersen, M. L., Richter, E. A., Hansen, T., Jørgensen, M. E. & Wojtaszewski, J. F. P., 2024, I: Nature Metabolism. 6, s. 2254–2266

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  1 Downloads (Pure)
• 2023

  Colonialism in South Africa leaves a lasting legacy of reduced genetic diversity in Cape buffalo

  Quinn, L., Garcia-Erill, G., Santander, C., Brüniche-Olsen, A., Liu, X., Sinding, M-H. S., Heaton, M. P., Smith, T. P. L., Pečnerová, P., Bertola, L. D., Hanghøj, K., Rasmussen, M. S., de Jager, D., Siegismund, H. R., Albrechtsen, A., Heller, R. & Moltke, I., 2023, I: Molecular Ecology. 32, 8, 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  8 Citationer (Scopus)

  33 Downloads (Pure)

• Estimating admixture pedigrees of recent hybrids without a contiguous reference genome

  Garcia-Erill, G., Hanghøj, K., Heller, R., Wiuf, C. & Albrechtsen, A., 2023, I: Molecular Ecology Resources. 23, 7, s. 1604-1619 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  22 Downloads (Pure)
• 2022

  An LDLR missense variant poses high risk of familial hypercholesterolemia in 30% of Greenlanders and offers potential of early cardiovascular disease intervention

  Jørsboe, E., Andersen, M. K., Skotte, L., Stæger, F. F., Færgeman, N. J., Hanghøj, K., Santander, C. G., Senftleber, N. K., Diaz, L. J., Overvad, M., Waples, R. K., Geller, F., Bjerregaard, P., Melbye, M., Larsen, C. V. L., Feenstra, B., Anders Koch, K., Jørgensen, M. E., Grarup, N., Moltke, I. & 2 flere, Albrechtsen, A. & Hansen, T., 2022, I: Human Genetics and Genomics Advances. 3, 4, 10 s., 100118.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  12 Citationer (Scopus)

  49 Downloads (Pure)

• Loss of sucrase-isomaltase function increases acetate levels and improves metabolic health in Greenlandic cohorts

  Andersen, M. K., Skotte, L., Jørsboe, E., Polito, R., Stæger, F. F., Aldiss, P., Hanghøj, K., Waples, R. K., Santander, C. G., Grarup, N., Dahl-Petersen, I. K., Diaz, L. J., Overvad, M., Senftleber, N. K., Søborg, B., Larsen, C. V. L., Lemoine, C., Pedersen, O., Feenstra, B., Bjerregaard, P. & 9 flere, Melbye, M., Jørgensen, M. E., Færgeman, N. J., Koch, A., Moritz, T., Gillum, M. P., Moltke, I., Hansen, T. & Albrechtsen, A., 2022, I: Gastroenterology. 162, 4, s. 1171-1182.e3

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  40 Downloads (Pure)
• 2021

  Detecting selection in low-coverage high-throughput sequencing data using principal component analysis

  Meisner, J., Albrechtsen, A. & Hanghøj, K., 2021, I: BMC Bioinformatics. 22, 13 s., 470.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  11 Citationer (Scopus)

  36 Downloads (Pure)

• High genetic diversity and low differentiation reflect the ecological versatility of the African leopard

  Pečnerová, P., Garcia-Erill, G., Liu, X., Nursyifa, C., Waples, R. K., Santander, C. G., Quinn, L., Frandsen, P., Meisner, J., Stæger, F. F., Rasmussen, M. S., Brüniche-Olsen, A., Jørgensen, C. H. F., da Fonseca, R. R., Siegismund, H. R., Albrechtsen, A., Heller, R., Moltke, I. & Hanghøj, K., 2021, I: Current Biology. 31, 9, s. 1862-1871, e1-e5

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  33 Downloads (Pure)

• NGSremix: A software tool for estimating pairwise relatedness between admixed individuals from next-generation sequencing data

  Nøhr, A. K., Hanghøj, K., Garcia-Erill, G., Li, Z., Moltke, I. & Albrechtsen, A., 2021, I: G3: Genes, Genomes, Genetics. 11, 8, 8 s., jkab174.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  32 Downloads (Pure)
• 2020

  Targeted conservation genetics of the endangered chimpanzee

  Frandsen, P., Fontsere, C., Nielsen, S. V., Hanghøj, K., Castejon-Fernandez, N., Lizano, E., Hughes, D., Hernandez-Rodriguez, J., Korneliussen, T. S., Carlsen, F., Siegismund, H. R., Mailund, T., Marques-Bonet, T. & Hvilsom, C., 2020, I: Heredity. 125, 1-2, s. 15-27 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  13 Citationer (Scopus)

• The derived allele of a novel intergenic variant at chromosome 11 associates with lower body mass index and a favorable metabolic phenotype in Greenlanders

  Andersen, M. K., Jørsboe, E., Skotte, L., Hanghøj, K., Sandholt, C. H., Moltke, I., Grarup, N., Kern, T., Mahendran, Y., Søborg, B., Bjerregaard, P., Larsen, C. V. L., Dahl-Petersen, I. K., Tiwari, H. K., Feenstra, B., Koch, A., Wiener, H. W., Hopkins, S. E., Pedersen, O., Melbye, M. & 4 flere, Boyer, B. B., Jørgensen, M. E., Albrechtsen, A. & Hansen, T., 2020, I: PLOS Genetics. 16, 1, 17 s., e1008544.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  7 Citationer (Scopus)

  65 Downloads (Pure)
• 2019

  DamMet: ancient methylome mapping accounting for errors, true variants, and post-mortem DNA damage

  Hanghøj, K., Renaud, G., Albrechtsen, A. & Orlando, L., 2019, I: GigaScience. 8, 4, 6 s., giz025.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  15 Citationer (Scopus)

  100 Downloads (Pure)

• Fast and accurate relatedness estimation from high-throughput sequencing data in the presence of inbreeding

  Hanghøj, K., Moltke, I., Andersen, P. A., Manica, A. & Korneliussen, T. S., maj 2019, I: GigaScience. 8, 5, 9 s., giz034.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  95 Citationer (Scopus)

  90 Downloads (Pure)

• Joint Estimates of Heterozygosity and Runs of Homozygosity for Modern and Ancient Samples

  Renaud, G., Hanghøj, K., Korneliussen, T. S., Willerslev, E. & Orlando, L., 2019, I: Genetics (Print). 212, 3, s. 587-614 28 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  44 Citationer (Scopus)

  314 Downloads (Pure)

• Tracking Five Millennia of Horse Management with Extensive Ancient Genome Time Series

  Fages, A., Hanghøj, K., Khan, N., Gaunitz, C., Seguin-Orlando, A., Leonardi, M., McCrory Constantz, C., Gamba, C., Al-Rasheid, K. A. S., Albizuri, S., Alfarhan, A. H., Allentoft, M., Alquraishi, S., Anthony, D., Baimukhanov, N., Barrett, J. H., Bayarsaikhan, J., Benecke, N., Bernáldez-Sánchez, E., Berrocal-Rangel, L. & 101 flere, Biglari, F., Boessenkool, S., Boldgiv, B., Brem, G., Brown, D., Burger, J., Crubézy, E., Daugnora, L., Davoudi, H., Damgaard, P. D. B., de los Ángeles de Chorro y de Villa-Ceballos, M., Deschler-Erb, S., Detry, C., Dill, N., do Mar Oom, M., Dohr, A., Ellingvåg, S., Erdenebaatar, D., Fathi, H., Felkel, S., Fernández-Rodríguez, C., García-Viñas, E., Germonpré, M., Granado, J. D., Hallsson, J. H., Hemmer, H., Hofreiter, M., Kasparov, A., Khasanov, M., Khazaeli, R., Kosintsev, P., Kristiansen, K., Kubatbek, T., Kuderna, L., Kuznetsov, P., Laleh, H., Leonard, J. A., Lhuillier, J., Liesau von Lettow-Vorbeck, C., Logvin, A., Lõugas, L., Ludwig, A., Luis, C., Arruda, A. M., Marques-Bonet, T., Matoso Silva, R., Merz, V., Mijiddorj, E., Miller, B. K., Monchalov, O., Mohaseb, F. A., Morales, A., Nieto-Espinet, A., Nistelberger, H., Onar, V., Pálsdóttir, A. H., Pitulko, V., Pitskhelauri, K., Pruvost, M., Rajic Sikanjic, P., Rapan Papeša, A., Roslyakova, N., Sardari, A., Sauer, E., Schafberg, R., Scheu, A., Schibler, J., Schlumbaum, A., Serrand, N., Serres-Armero, A., Shapiro, B., Sheikhi Seno, S., Shevnina, I., Shidrang, S., Southon, J., Star, B., Sykes, N., Taheri, K., Taylor, W., Teegen, W. R., Trbojević Vukičević, T., Trixl, S., Tumen, D., Undrakhbold, S., Usmanova, E., Vahdati, A., Valenzuela-Lamas, S., Viegas, C., Wallner, B., Weinstock, J., Zaibert, V., Clavel, B., Lepetz, S., Mashkour, M., Helgason, A., Stefánsson, K., Barrey, E., Willerslev, E., Outram, A. K., Librado, P. & Orlando, L., 2019, I: Cell. 177, 6, s. 1419-1435, e1-e31

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  185 Citationer (Scopus)

  185 Downloads (Pure)
• 2018

  Ancient genomes revisit the ancestry of domestic and Przewalski's horses

  Gaunitz, C., Fages, A. A., Hanghøj, K. E., Albrechtsen, A., Khan, N., Schubert, M., Seguin-Orlando, A., Owens, I. J., Felkel, S., Bignon-Lau, O., Damgaard, P. D. B., Mittnik, A., Mohaseb, A. F., Davoudi, H., Alquraishi, S., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A. S., Crubézy, E., Benecke, N., Olsen, S. & 27 flere, Brown, D., Anthony, D., Massy, K., Pitulko, V., Kasparov, A., Brem, G., Hofreiter, M., Mukhtarova, G., Baimukhanov, N., Lõugas, L., Onar, V., Stockhammer, P. W., Krause, J., Boldgiv, B., Undrakhbold, S., Erdenebaatar, D., Lepetz, S., Mashkour, M., Ludwig, A., Wallner, B., Merz, V., Merz, I., Zaibert, V., Willerslev, E., Sanz, P. L., Outram, A. K. & Orlando, L. A. A., 2018, I: Science. 360, 6384, s. 111-114 4 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  234 Citationer (Scopus)

• Genomic investigations of horse domestication using ancient DNA and a novel statistical method for epigenomic inference from ancient DNA sequencing data

  Hanghøj, K. E., 2018, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen.

  Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

  Fil

• Oral health status in historic population: Macroscopic and metagenomic evidence

  Willmann, C., Mata, X., Hanghoej, K., Tonasso, L., Tisseyre, L., Jeziorski, C., Cabot, E., Chevet, P., Crubézy, E., Orlando, L., Esclassan, R., Thèves, C. & Caramelli, D., 2018, I: PLOS ONE. 13, 5, 18 s., e0196482.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  22 Citationer (Scopus)

  140 Downloads (Pure)
• 2017

  Combining bleach and mild predigestion improves ancient DNA recovery from bones

  Boessenkool, S., Hanghøj, K. E., Nistelberger, H. M., Der Sarkissian, C., Gondek, A. T., Orlando, L. A. A., Barrett, J. H. & Star, B., jul. 2017, I: Molecular Ecology Resources. 17, 4, s. 742–751 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  77 Citationer (Scopus)

• fastNGSadmix: admixture proportions and principal component analysis of a single NGS sample

  Jørsboe, E., Hanghøj, K. E. & Albrechtsen, A., 1 okt. 2017, I: Bioinformatics. 33, 19, s. 3148-3150 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  20 Citationer (Scopus)

• gargammel: a sequence simulator for ancient DNA

  Renaud, G., Hanghøj, K. E., Willerslev, E. & Orlando, L. A. A., 2017, I: Bioinformatics. 33, 4, s. 577-579 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  67 Citationer (Scopus)

  258 Downloads (Pure)
• 2016

  Clonal yeast biofilms can reap competitive advantages through cell differentiation without being obligatorily multicellular

  Regenberg, B., Hanghøj, K. E., Andersen, K. S. & Boomsma, J. J., 2016, I: Royal Society of London. Proceedings B. Biological Sciences. 283, 1842, 8 s., 20161303.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  16 Citationer (Scopus)

• Comparing the performance of three ancient DNA extraction methods for high-throughput sequencing

  Gamba, C., Hanghøj, K. E., Gaunitz, C., Alfarhan, A. H., Alquraishi, S. A., Al-Rasheid, K. A. S., Bradley, D. G. & Orlando, L. A. A., 2016, I: Molecular Ecology Resources. 16, 2, s. 459-469 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  125 Citationer (Scopus)

• Fast, accurate and automatic ancient nucleosome and methylation maps with epiPALEOMIX

  Hanghøj, K. E., Seguin-Orlando, A., Schubert, M., Madsen, T., Pedersen, J. S., Willerslev, E. & Orlando, L. A. A., 2016, I: Molecular Biology and Evolution. 33, 12, s. 3284-3298 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  27 Citationer (Scopus)

  578 Downloads (Pure)

• metaBIT, an integrative and automated metagenomic pipeline for analysing microbial profiles from high-throughput sequencing shotgun data

  Louvel, G., Der Sarkissian, C., Hanghøj, K. E. & Orlando, L. A. A., nov. 2016, I: Molecular Ecology Resources. 16, 6, s. 1415-1427 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  30 Citationer (Scopus)

• The evolutionary origin and genetic makeup of domestic horses

  Sanz, P. L., Fages, A. A., Gaunitz, C., Leonardi, M., Wagner, S., Khan, N., Hanghøj, K. E., Alquraishi, S. A., Alfarhan, A. H., Al-Rasheid, K. A., Der Sarkissian, C., Schubert, M. & Orlando, L. A. A., okt. 2016, I: Genetics. 204, 2, s. 423-434 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  61 Citationer (Scopus)