Kristoffer Enøe Johansson

Publikation

Publikationer pr. år 2010 2012 2013 2016 2017 2018 2019 2021 2022 2023 2024 2024

• 455 Citationer
• 29 Tidsskriftartikel
• 2 Poster
• 1 Bog
• 1 Ph.d.-afhandling
• 3 Mere
  • 1 Konferenceabstrakt i proceedings
  • 1 Kommentar/debat
  • 1 Letter

Publikationer pr. år

Publikationer pr. år

Søgeresultater

• 2024

  A mutational atlas for Parkin proteostasis

  Clausen, L., Voutsinos, V., Cagiada, M., Johansson, K. E., Grønbæk-Thygesen, M., Nariya, S., Powell, R. L., Have, M. K. N., Oestergaard, V. H., Stein, A., Fowler, D. M., Lindorff-Larsen, K. & Hartmann-Petersen, R., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 17 s., 1541.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  15 Downloads (Pure)

• Conformational ensembles of the human intrinsically disordered proteome

  Tesei, G., Trolle, A. I., Jonsson, N., Betz, J., Knudsen, F. E., Pesce, F., Johansson, K. E. & Lindorff-Larsen, K., 2024, I: Nature. 626, s. 897-904 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  23 Citationer (Scopus)

  15 Downloads (Pure)

• Deep mutational scanning reveals a correlation between degradation and toxicity of thousands of aspartoacylase variants

  Grønbæk-Thygesen, M., Voutsinos, V., Johansson, K. E., Schulze, T. K., Cagiada, M., Pedersen, L., Clausen, L., Nariya, S., Powell, R. L., Stein, A., Fowler, D. M., Lindorff-Larsen, K. & Hartmann-Petersen, R., 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 18 s., 4026.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  6 Downloads (Pure)

• GMMA Can Stabilize Proteins Across Different Functional Constraints

  Daffern, N., Johansson, K. E., Baumer, Z. T., Robertson, N. R., Woojuh, J., Bedewitz, M. A., Davis, Z., Wheeldon, I., Cutler, S. R., Lindorff-Larsen, K. & Whitehead, T. A., 2024, I: Journal of Molecular Biology. 436, 11, 15 s., 168586.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
• 2023

  Global analysis of multi-mutants to improve protein function

  Johansson, K. E., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 8, 15 s., 168034.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• HSP70-binding motifs function as protein quality control degrons

  Abildgaard, A. B., Voutsinos, V., Petersen, S. D., Larsen, F. B., Kampmeyer, C., Johansson, K. E., Stein, A., Ravid, T., Andréasson, C., Jensen, M. K., Lindorff-Larsen, K. & Hartmann-Petersen, R., 2023, I: Cellular and Molecular Life Sciences. 80, 1, 17 s., 32.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  10 Citationer (Scopus)

  32 Downloads (Pure)

• Prediction of Quality-control Degradation Signals in Yeast Proteins

  Johansson, K. E., Mashahreh, B., Hartmann-Petersen, R., Ravid, T. & Lindorff-Larsen, K., 2023, I: Journal of Molecular Biology. 435, 2, 9 s., 167915.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  9 Citationer (Scopus)

  15 Downloads (Pure)

• Rapid protein stability prediction using deep learning representations

  Blaabjerg, L. M., Kassem, M. M., Good, L. L., Jonsson, N., Cagiada, M., Johansson, K. E., Boomsma, W., Stein, A. & Lindorff-Larsen, K., 2023, I: eLife. 12, 19 s., e82593.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  31 Downloads (Pure)
• 2022

  14-fold increased prevalence of rare glucokinase gene variant carriers in unselected Danish patients with newly diagnosed type 2 diabetes

  Gjesing, A. P., Engelbrechtsen, L., Cathrine B. Thuesen, A., Have, C. T., Hollensted, M., Grarup, N., Linneberg, A., Steen Nielsen, J., Christensen, L. B., Thomsen, R. W., Johansson, K. E., Cagiada, M., Gersing, S., Hartmann-Petersen, R., Lindorff-Larsen, K., Vaag, A., Sørensen, H. T., Brandslund, I., Beck-Nielsen, H., Pedersen, O. & 2 flere, Rungby, J. & Hansen, T., 2022, I: Diabetes Research and Clinical Practice. 194, 9 s., 110159.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  42 Downloads (Pure)

• Conserved degronome features governing quality control associated proteolysis

  Mashahreh, B., Armony, S., Johansson, K. E., Chappleboim, A., Friedman, N., Gardner, R. G., Hartmann-Petersen, R., Lindorff-Larsen, K. & Ravid, T., 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 13 s., 7588.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  12 Citationer (Scopus)

  13 Downloads (Pure)

• Increasing protein stability by inferring substitution effects from high-throughput experiments

  Norrild, R. K., Johansson, K. E., O'Shea, C., Morth, J. P., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2022, I: Cell Reports Methods. 2, 11, 11 s., 100333.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  4 Citationer (Scopus)

  23 Downloads (Pure)
• 2021

  Charge Interactions in a Highly Charge-Depleted Protein

  Hervø-Hansen, S., Højgaard, C., Johansson, K. E., Wang, Y., Wahni, K., Young, D., Messens, J., Teilum, K., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2021, I: Journal of the American Chemical Society. 143, 6, s. 2500-2508 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  18 Downloads (Pure)

• Computational and Experimental Assessment of Backbone Templates for Computational Redesign of the Thioredoxin Fold

  Marin, F. I., Johansson, K. E., O'Shea, C., Lindorff-Larsen, K. & Winther, J. R., 2021, I: The Journal of Physical Chemistry B. 125, 40, s. 11141-11149

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  4 Citationer (Scopus)

• Substitutional landscape of a split fluorescent protein fragment using high-density peptide microarrays

  Antonescu, O. N., Rasmussen, A., Damm, N. A. M., Heidemann, D. F., Popov, R., Nesterov-Mueller, A., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 2021, I: PLoS ONE. 16, 2, 17 s., e0241461.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  79 Downloads (Pure)

• Understanding the Origins of Loss of Protein Function by Analyzing the Effects of Thousands of Variants on Activity and Abundance

  Cagiada, M., Johansson, K. E., Valanciute, A., Nielsen, S. V., Hartmann-Petersen, R., Yang, J. J., Fowler, D. M., Stein, A. & Lindorff-Larsen, K., 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 8, s. 3235-3246

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  45 Citationer (Scopus)

  49 Downloads (Pure)
• 2020

  Global analysis of protein stability by temperature and chemical denaturation

  Hamborg, L., Horsted, E. W., Johansson, K. E., Willemoës, M., Lindorff-Larsen, K. & Teilum, K., 2020, I: Analytical Biochemistry. 605, 7 s., 113863.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  17 Citationer (Scopus)
• 2019

  Improving folding properties of computationally designed proteins

  Bjerre, B., Nissen, J., Madsen, M., Kamarauskaite, J., Norrild, R. K., Holm, P. C., Nordentoft, M. K., O'Shea, C., Willemoës, M., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 13 dec. 2019, I: Protein Engineering Design and Selection (Print). 32, 3, s. 145-151 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  3 Citationer (Scopus)

• Shining light on split fluorescent protein fitness landscapes using peptide array-based deep substitutional scanning

  ANTONESCU, OANA-NICOLETA., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 30 jun. 2019.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review
• 2018

  Characterization of the hydrodynamics in a miniaturized dissolution apparatus

  Johansson, K. E., Plum, J., Mosleh, M., Madsen, C. M., Rades, T. & Müllertz, A., 2018, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 107, 4, s. 1095-1103 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  8 Citationer (Scopus)

• Comprehensive mapping of GFP structure-function relationship using high-density peptide arrays

  Antonescu, O-N., Johansson, K. E. & Winther, J. R., 10 jul. 2018.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• Protein evolution: Hacking an enzyme

  Johansson, K. E. & Winther, J. R., 2018, I: Nature Chemical Biology. 14, 3, s. 202-204 3 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Kommentar/debat › Forskning › peer review

• Structural heterogeneity and dynamics in protein evolution and design

  Johansson, K. E. & Lindorff-Larsen, K., 2018, I: Current Opinion in Structural Biology. 48, s. 157-163 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  34 Citationer (Scopus)
• 2017

  Computational Dehydration of Crystalline Hydrates Using Molecular Dynamics Simulations

  Larsen, A. S., Rantanen, J. & Johansson, K. E., 2017, I: Journal of Pharmaceutical Sciences. 106, 1, s. 348-355 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  16 Citationer (Scopus)

• Tracking dehydration mechanisms in crystalline hydrates with molecular dynamics simulations

  Larsen, A. S., Ruggiero, M. T., Johansson, K. E., Zeitler, J. A. & Rantanen, J., okt. 2017, I: Crystal Growth & Design. 17, 10, s. 5017-5022 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Letter › Forskning › peer review
  27 Citationer (Scopus)
• 2016

  A soluble, folded protein without charged amino acid residues

  Højgaard, C., Kofoed, C., Espersen, R., Johansson, K. E., Villa, M., Willemoës, M., Lindorff-Larsen, K., Teilum, K. & Winther, J. R., 2016, I: Biochemistry. 55, 28, s. 3949–3956 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  29 Citationer (Scopus)

  323 Downloads (Pure)

• Computational redesign of thioredoxin is hypersensitive towards minor conformational changes in the backbone template

  Johansson, K. E., Johansen, N. T., Christensen, S., Horowitz, S., Bardwell, J. C. A., Olsen, J. G., Willemoës, M., Lindorff-Larsen, K., Ferkinghoff-Borg, J., Hamelryck, T. W. & Winther, J. R., 2016, I: Journal of Molecular Biology. 428, 21, s. 4361-4377 17 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  257 Downloads (Pure)

• Local structure in the disordered solid solution of cis- and trans-perinones

  Teteruk, J. L., Glinnemann, J., Heyse, W., Johansson, K. E., van de Streek, J. & Schmidt, M. U., jun. 2016, I: Acta Crystallographica. Section B: Structural Science. B72, s. 416-433 18 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  11 Citationer (Scopus)

• Revision of the Crystal Structure of the First Molecular Polymorph in History

  Johansson, K. E. & Van De Streek, J., 2 mar. 2016, I: Crystal Growth & Design. 16, 3, s. 1366-1370 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  11 Citationer (Scopus)
• 2014

  Distinguishing tautomerism in the crystal structure of (Z)-N-(5-ethyl-2,3-dihydro-1,3,4-thiadiazol-2-ylidene)-4-methylbenzenesulfonamide using DFT-D calculations and (13)C solid-state NMR

  Li, X., Bond, A. D., Johansson, K. E. & Van de Streek, J., 15 aug. 2014, I: Acta Crystallographica. Section C: Crystal Structure Communications. C70, Pt 8, s. 784-9 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  18 Citationer (Scopus)
• 2013

  A simple probabilistic model of multibody interactions in proteins

  Johansson, K. E. & Hamelryck, T., 2013, I: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 81, 8, s. 1340-1350 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  6 Citationer (Scopus)

• PHAISTOS: a framework for Markov chain Monte Carlo simulation and inference of protein structure

  Boomsma, W. K., Frellsen, J., Harder, T. P., Bottaro, S., Johansson, K. E., Tian, P., Stovgaard, K., Andreetta, C., Olsson, S., Valentin, J., Antonov, L. D., Christensen, A. S., Borg, M., Jensen, J. H., Lindorff-Larsen, K., Ferkinghoff-Borg, J. & Hamelryck, T. W., 2013, I: Journal of Computational Chemistry. 34, 19, s. 1697-1705 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  34 Citationer (Scopus)

• Phaistos user manual

  Boomsma, W., Bottaro, S., Hamelryck, T., Frellsen, J., Andreetta, C., Borg, M., Harder, T., Johansson, K. E., Stovgaard, K. & Tian, P., 2013, 90 s.

  Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Bog › Undervisning
• 2012

  Computational Protein Design

  Johansson, K. E., 2012, Department of Biology, Faculty of Science, University of Copenhagen. 151 s.

  Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

  Fil

• Subtle Monte Carlo updates in dense molecular systems

  Bottaro, S., Boomsma, W. K., Johansson, K. E., Andreetta, C., Hamelryck, T. W. & Ferkinghoff-Borg, J., 2012, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 8, 2, s. 695-702 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  21 Citationer (Scopus)
• 2011

  Efficient, non-disruptive local moves for Monte Carlo sampling of proteins

  Bottaro, S., Boomsma, W. K., Johansson, K. E., Andreetta, C., Hamelryck, T. W. & Ferkinghoff-Borg, J., 2011, Next Generation Statistics in Biosciences: Proceedings of the 30th Leeds Annual Statistical Research (LASR) Workshop. Mardia, K. V., Gusnanto, A., Riley, A. D. & Voss, J. (red.). University of Leeds, s. 127 1 s.

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Konferenceabstrakt i proceedings › Forskning
• 2010

  Beyond rotamers: a generative, probabilistic model of side chains in proteins

  Harder, T., Boomsma, W. K., Paluszewski, M., Frellsen, J., Johansson, K. E. & Hamelryck, T. W., 1 jan. 2010, I: B M C Bioinformatics. 11, s. 306

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  44 Citationer (Scopus)

  1067 Downloads (Pure)