Leise Riber

Søgeresultater

• 2024

  Now and then in eukaryotic DNA methylation

  Stein, R. A., Gomaa, F. E., Raparla, P. & Riber, L., 2024, I: Physiological Genomics. 56, 11, s. 741-763 23 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
• 2023

  Detection of nucleotide modifications in bacteria and bacteriophages: Strengths and limitations of current technologies and software

  Nielsen, T. K., Forero-Junco, L. M., Kot, W., Moineau, S., Hansen, L. H. & Riber, L., 2023, I: Molecular Ecology. 32, 6, s. 1236-1247 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  32 Downloads (Pure)

• Epigenetic effects of short-chain fatty acids from the large intestine on host cells

  Stein, R. A. & Riber, L., 2023, I: microLife. 4, 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  13 Citationer (Scopus)

  9 Downloads (Pure)

• Pheno- and Genotyping of Three Novel Bacteriophage Genera That Target a Wheat Phyllosphere Sphingomonas Genus

  Riber, L., Carstens, A. B., Dougherty, P. E., Roy, C., Willenbücher, K., Hille, F., Franz, C. M. A. P. & Hansen, L. H., 2023, I: Microorganisms. 11, 7, 17 s., 1831.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• Widespread and largely unknown prophage activity, diversity, and function in two genera of wheat phyllosphere bacteria

  Dougherty, P. E., Nielsen, T. K., Riber, L., Lading, H. H., Forero-Junco, L. M., Kot, W., Raaijmakers, J. M. & Hansen, L. H., 2023, I: ISME Journal. 17, 12, s. 2415-2425

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  21 Downloads (Pure)
• 2021

  An improved direct metamobilome approach increases the detection of larger-sized circular elements across kingdoms

  Alanin, K. W. S., Jørgensen, T. S., Browne, P. D., Petersen, B., Riber, L., Kot, W. & Hansen, L. H., 2021, I: Plasmid. 115, 11 s., 102576.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Fil
  5 Citationer (Scopus)

  19 Downloads (Pure)

• Bacterial Chromosomes Under Changing Environmental Conditions: Editorial

  Glinkowska, M., Waldminghaus, T. & Riber, L., 2021, I: Frontiers in Microbiology. 12, 3 s., 633466.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  16 Downloads (Pure)

• Epigenetic Memories: The Hidden Drivers of Bacterial Persistence?

  Riber, L. & Hansen, L. H., 2021, I: Trends in Microbiology. 29, 3, s. 190-194 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Leder › Forskning

  Åben adgang

  Fil
  33 Citationer (Scopus)

  23 Downloads (Pure)

• Extension of Plant Phenotypes by the Foliar Microbiome

  Hawkes, C. V., Kjøller, R., Raaijmakers, J. M., Riber, L., Christensen, S., Rasmussen, S., Christensen, J. H., Dahl, A. B., Westergaard, J. C., Nielsen, M., Brown-Guedira, G. & Hestbjerg Hansen, L., 2021, I: Annual Review of Plant Biology. 72, s. 823-846 24 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  33 Citationer (Scopus)
• 2020

  A converging subset of soil bacterial taxa is permissive to the IncP-1 plasmid pKJK5 across a range of soil copper contamination

  Song, J., Klümper, U., Riber, L., Dechesne, A., Smets, B. F., Sørensen, S. J. & Brandt, K. K., 2020, I: FEMS Microbiology Ecology. 96, 11, 10 s., fiaa200.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  9 Citationer (Scopus)

  12 Downloads (Pure)

• Bacterial Chromosome Replication and DNA Repair During the Stringent Response

  Sinha, A. K., Løbner-Olesen, A. & Riber, L., 2020, I: Frontiers in Microbiology. 11, 9 s., 582113.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  8 Citationer (Scopus)

  32 Downloads (Pure)

• Inhibition of Escherichia coli chromosome replication by rifampicin treatment or during the stringent response is overcome by de novo DnaA protein synthesis

  Riber, L. & Løbner-Olesen, A., 2020, I: Molecular Microbiology. 114, 6, s. 906-919

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  13 Citationer (Scopus)

  51 Downloads (Pure)

• Selection and propagation of IncP conjugative plasmids following long-term anthropogenic metal pollution in river sediments

  Cyriaque, V., Jacquiod, S. J. A., Riber, L., Abu Al-Soud, W., Gillan, D. C., Sørensen, S. J. & Wattiez, R., 2020, I: Journal of Hazardous Materials. 382, 10 s., 121173.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  10 Citationer (Scopus)
• 2018

  An intriguing relationship between the cyclic diguanylate signaling system and horizontal gene transfer

  Madsen, J. S., Hylling, O., Jacquiod, S. J. A., Pécastaings, S., Hansen, L. H., Riber, L., Vestergaard, G. A. & Sørensen, S. J., 2018, I: ISME Journal. 12, 9, s. 2330-2334 5 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  19 Citationer (Scopus)

• A Robust Proton Flux (pHlux) Assay for Studying the Function and Inhibition of the Influenza A M2 Proton Channel

  Santner, P., Martins, J. M. D. S., Laursen, J. S., Behrendt, L., Riber, L., Olsen, C. A., Arkin, I. T., Winther, J. R., Willemoës, M. & Lindorff-Larsen, K., 2018, I: Biochemistry. 57, 41, s. 5949-5956

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  14 Citationer (Scopus)

• Countermeasures to survive excessive chromosome replication in Escherichia coli

  Charbon, G., Riber, L. & Løbner-Olesen, A., 2018, I: Current Genetics. 64, 1, s. 71-79 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  13 Citationer (Scopus)

• Fluorescence recovery allows theimplementation of a fluorescence reporter gene platform applicable for the detection and quantification of horizontal gene transfer in anoxic environments

  Pinilla-Redondo, R., Riber, L. & Sørensen, S. J., 2018, I: Applied and Environmental Microbiology. 84, 6, 9 s., e02507-17.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  14 Citationer (Scopus)

• HipA-Mediated Phosphorylation of SeqA Does not Affect Replication Initiation in Escherichia coli

  Riber, L., Koch, B. M., Kruse, L. R., Germain, E. & Løbner-Olesen, A., 2 nov. 2018, I: Frontiers in Microbiology. 9, s. 1-9 2637.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  2 Citationer (Scopus)

  98 Downloads (Pure)

• Long-term industrial metal contamination unexpectedly shaped diversity and activity response of sediment microbiome

  Jacquiod, S. J. A., Cyriaque, V., Riber, L., Al-Soud, W. A., Gillan, D. C., Wattiez, R. & Sørensen, S. J., 15 feb. 2018, I: Journal of Hazardous Materials. 344, s. 299-307 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  80 Citationer (Scopus)

• Monitoring plasmid-mediated horizontal gene transfer in microbiomes: recent advances and future perspectives

  Pinilla Redondo, R., Cyriaque, V., Jacquiod, S., Sørensen, S. J. & Riber, L., 2018, I: Plasmid. 99, s. 56-67

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review
  47 Citationer (Scopus)
• 2017

  Deciphering conjugative plasmid permissiveness in wastewater microbiomes

  Jacquiod, S. J. A., Brejnrod, A. D., Milani, S. M., Abu Al-Soud, W., Sørensen, S. J. & Riber, L., jul. 2017, I: Molecular Ecology. 26, 13, s. 3556-3571 16 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  61 Citationer (Scopus)

• Metal stressors consistently modulate bacterial conjugal plasmid uptake potential in a phylogenetically conserved manner

  Klümper, U., Dechesne, A., Riber, L., Brandt, K. K., Gülay, A., Sørensen, S. J. & Smets, B. F., 2017, I: The ISME Journal. 11, 1, s. 152-165 14 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang
  106 Citationer (Scopus)

• Response of the bacterial community in an on-farm biopurification system, to which diverse pesticides are introduced over an agricultural season

  Holmsgaard, P. N., Dealtry, S., Dunon, V., Heuer, H., Hansen, L. H., Springael, D., Smalla, K., Riber, L. & Sørensen, S. J., okt. 2017, I: Environmental Pollution. 229, s. 854-862 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  29 Citationer (Scopus)
• 2016

  Diverse gene functions in a soil mobilome

  Luo, W., Xu, Z., Riber, L., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2016, I: Soil Biology & Biochemistry. 101, s. 175-183 9 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  20 Citationer (Scopus)

• Enhanced plasmid loss in bacterial populations exposed to the antimicrobial compound irgasan delivered from interpenetrating polymer network silicone hydrogels

  Riber, L., Burmølle, M., Alm, M., Milani, S. M., Thomsen, P., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2016, I: Plasmid. 87-88, s. 72-78 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  13 Citationer (Scopus)

• Multiple DNA binding proteins contribute to timing of chromosome replication in E. coli

  Riber, L., Frimodt-Møller, J., Charbon, G. & Løbner-Olesen, A., 2016, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 3, 9 s., 29.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  32 Citationer (Scopus)

  283 Downloads (Pure)

• Type 3 fimbriae encoded on plasmids are expressed from a unique promoter without affecting host motility, facilitating an exceptional phenotype that enhances conjugal plasmid transfer

  Madsen, J. S., Riber, L., Kot, W. P., Basfeld, A., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2016, I: P L o S One. 11, 9, 19 s., e0162390.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  312 Downloads (Pure)
• 2015

  Broad host range plasmids can invade an unexpectedly diverse fraction of a soil bacterial community

  Klümper, U., Riber, L., Dechesne, A., Sannazzaro, A. I., Hansen, L. H., Sørensen, S. J. & Smets, B. F., 2015, I: I S M E Journal. 9, s. 934-945 12 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  294 Citationer (Scopus)

• Phenotypic variability in bioprocessing conditions can be tracked on the basis of on-line flow cytometry and fits to a scaling law

  Baert, J., Kinet, R., Brognaux, A., Delepierre, A., Telek, S., Sørensen, S. J., Riber, L., Fickers, P. & Delvigne, F., 2015, I: Biotechnology Journal. 10, 8, s. 1316-1325 10 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  27 Citationer (Scopus)
• 2014

  An improved method for including upper size range plasmids in metamobilomes

  Norman, A., Riber, L., Luo, W., Li, L., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2014, I: PLoS ONE. 9, 8, 12 s., e104405.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  30 Citationer (Scopus)

  1205 Downloads (Pure)

• Exploring the immediate and long-term impact on bacterial communities in soil amended with animal and urban organic waste fertilizers using pyrosequencing and screening for horizontal transfer of antibiotic resistance

  Riber, L., Poulsen, P. H. B., Abu Al-Soud, W., Hansen, L. B. S., Bergmark, L., Brejnrod, A. D., Norman, A., Hansen, L. H., Magid, J. & Sørensen, S. J., 2014, I: F E M S Microbiology Ecology. 90, 1, s. 206-224 19 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  74 Citationer (Scopus)
• 2013

  Complete genome sequence of the cystic fibrosis pathogen Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complies with important pathogenic phenotypes

  Jakobsen, T. H., Hansen, M. A., Jensen, P. Ø., Hansen, L., Riber, L., Cockburn, A. P. I., Kolpen, M., Hansen, C. R., Ridderberg, W., Eickhardt-Sørensen, S. R., Hansen, M., Kerpedjiev, P., Alhede, M., Qvortrup, K., Burmølle, M., Moser, C. E., Kühl, M., Ciofu, O., Givskov, M., Sørensen, S. J. & 2 flere, Høiby, N. & Bjarnsholt, T., 2013, I: P L o S One. 8, 7, 17 s., e68484.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  79 Citationer (Scopus)

  3042 Downloads (Pure)

• Investigating the diversity of Pseudomonas spp. in soil using culture dependent and independent techniques

  Li, L., Abu Al-Soud, W., Bergmark, L., Riber, L., Hansen, L. H., Magid, J. & Sørensen, S. J., 2013, I: Current Microbiology. 67, 4, s. 423-430 8 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  17 Citationer (Scopus)
• 2012

  Design and synthesis of a functional self-replicating, broad host range cloning vector from bits and bytes

  Riber, L., Norman, A., Sørensen, S. J. & Hansen, L. H., 2012.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid stability

  Riber, L., Burmølle, M., Milani, S. M., Alm, M., Thomsen, P., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• When it makes sense to socialize whilst being on the move: A small EAL-domain containing protein, encoded on natural biofilm-promoting plasmids, triggers motility

  Madsen, J. S., Riber, L., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2012.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
• 2011

  Attachment of Salmonella spp. to pork meat

  Hansen, T., Riber, L., Lofstrom, C. & Hoorfar, J., 2011.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid transfer and stability

  Riber, L., Charbon, G., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2011.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning › peer review

• Microarray-based genotyping of Salmonella: inter-laboratory evaluation of reproducibility and standardization potential

  Gronlund, H., Riber, L., Vigre, H., Lofstrom, C., Folling, L., Huehn, S., Malorny, B., Radstrom, P., Rudi, K. & Hoorfar, J., 2011, I: International Journal of Food Microbiology. 145, 1, s. S79-S85 7 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  5 Citationer (Scopus)

• Suppressors of DnaA^ATP imposed overinitiation in Escherichia coli

  Charbon, G., Riber, L., Cohen, M., Skovgaard, O., Fujimitsu, K., Katayama, T. & Løbner-Olesen, A., 2011, I: Molecular Microbiology. 79, 4, s. 914-928 15 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  29 Citationer (Scopus)
• 2010

  Centre for Anti-resistance; Limiting the occurrence of antimicrobial resistance through targeted interventions directed at plasmid transfer and stability

  Riber, L., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J., 2010.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Characterization of hda suppressor mutants (hsm’s)

  Bjørn, L., Charbon, G., Skovgaard, O., Riber, L. & Olesen, A. L., 2010.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Genomic rearrangements and mutations identified by next generation sequencing

  Skovgaard, O., Bak, M., Bjørn, L., Charbon, G., Riber, L. & Olesen, A. L., 2010.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• SeqA contributes to control the amount of DnaA molecules available for initiation of replication

  Charbon, G., Riber, L., Bjørn, L., Skovgaard, O. & Olesen, A. L., 2010.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Towards standardization of microarray-based genotyping of Salmonella

  Lofstrom, C., Grønlund, H., Riber, L., Vigre, H., Folling, L., Huehn, S., Malorny, B., Rådstrom, P., Rudi, K. & Hoorfar, J., 2010.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
• 2009

  Loss of Hda activity stimulates replication initiation from I-box, but not R4 mutant origins in Escherichia coli

  Riber, L., Fujimitsu, K., Katayama, T. & Løbner-Olesen, A., 2009, I: Molecular Microbiology. 71, 1, s. 107-122

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  35 Citationer (Scopus)

• Salmonella genes involved in attachment on carcass surface and pork meat contamination

  Riber, L., Lofstrom, C. & Hoorfar, J., 2009.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
• 2008

  Genome rearrangements in E. coli identified by HTP sequencing

  Skovgaard, O., Bak, M., Riber, L., Olesen, A. L. & Tommerup, N., 2008.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning

• Salmonella genes involved in attachment on carcass surface and pork meat contamination

  Riber, L. & Hoorfar, J., 2008.

  Publikation: Konferencebidrag › Poster › Forskning
• 2006

  Hda-mediated inactivation of the DnaA protein and dnaA gene autoregulation act in concert to ensure homeostatic maintenance of the Escherichia coli chromosome

  Riber, L., Olsson, J. A., Jensen, R. B., Skovgaard, O., Dasgupta, S., Marinus, M. G. & Løbner-Olesen, A., 2006, I: Genes & Development. 20, 15, s. 2121-2134

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review
  65 Citationer (Scopus)