Lili Niu

Søgeresultater

• 2024

  Full Mass Range ΦSDM Orbitrap Mass Spectrometry for DIA Proteome Analysis

  Steigerwald, S., Sinha, A., Fort, K. L., Zeng, W-F., Niu, L., Wichmann, C., Kreutzmann, A., Mourad, D., Aizikov, K., Grinfeld, D., Makarov, A., Mann, M. & Meier, F., 2024, I: Molecular and Cellular Proteomics. 12 s., 100713.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Citationer (Scopus)

  17 Downloads (Pure)

• Imputation of label-free quantitative mass spectrometry-based proteomics data using self-supervised deep learning

  Webel, H., Niu, L., Nielsen, A. B., Locard-Paulet, M., Mann, M., Jensen, L. J. & Rasmussen, S., 2024, I: Nature Communications. 15, 15 s., 5405.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  9 Downloads (Pure)

• Opportunities and barriers in omics-based biomarker discovery for steatotic liver diseases

  Thiele, M., Villesen, I. F., Niu, L., Johansen, S., Sulek, K., Nishijima, S., Espen, L. V., Keller, M., Israelsen, M., Suvitaival, T., Zawadzki, A. D., Juel, H. B., Brol, M. J., Stinson, S. E., Huang, Y., Silva, M. C. A., Kuhn, M., Anastasiadou, E., Leeming, D. J., Karsdal, M. & 12 flere, Matthijnssens, J., Arumugam, M., Dalgaard, L. T., Legido-Quigley, C., Mann, M., Trebicka, J., Bork, P., Jensen, L. J., Hansen, T., Krag, A., MicrobLiver Consortium & GALAXY Consortium, 2024, I: Journal of Hepatology. 81, 2, s. 345-359

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  8 Citationer (Scopus)

  6 Downloads (Pure)

• Unbiased Proteomic Exploration Suggests Overexpression of Complement Cascade Proteins in Plasma from Patients with Psoriasis Compared with Healthy Individuals

  Kromann, B., Niu, L., Møller, L. B. P., Sølberg, J., Sulek, K., Gyldenløve, M., Dyring-Andersen, B., Skov, L. & Løvendorf, M. B., 2024, I: International Journal of Molecular Sciences. 25, 16, 7 s., 8791.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  1 Downloads (Pure)
• 2023

  Discovery of drug-omics associations in type 2 diabetes with generative deep-learning models: [with Author Correction]

  Allesøe, R. L., Lundgaard, A. T., Hernández Medina, R., Aguayo-Orozco, A., Johansen, J., Nissen, J. N., Brorsson, C., Mazzoni, G., Niu, L., Biel, J. H., Brasas, V., Webel, H., Benros, M. E., Pedersen, A. G., Chmura, P. J., Jacobsen, U. P., Mari, A., Koivula, R., Mahajan, A., Vinuela, A. & 31 flere, Tajes, J. F., Sharma, S., Haid, M., Hong, M-G., Musholt, P. B., De Masi, F., Vogt, J., Pedersen, H. K., Gudmundsdottir, V., Jones, A., Kennedy, G., Bell, J., Thomas, E. L., Frost, G., Thomsen, H., Hansen, E., Hansen, T. H., Vestergaard, H., Muilwijk, M., Blom, M. T., 't Hart, L. M., Pattou, F., Raverdy, V., Brage, S., Ridderstråle, M., Pedersen, O., Hansen, T., Banasik, K., Rasmussen, S., Brunak, S. & IMI-DIRECT consortium, 2023, I: Nature Biotechnology. 41, 3, s. 399–408 18 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  40 Citationer (Scopus)

  94 Downloads (Pure)
• 2022

  A knowledge graph to interpret clinical proteomics data

  Santos, A., Colaço, A. R., Nielsen, A. B., Niu, L., Strauss, M., Geyer, P. E., Coscia, F., Albrechtsen, N. J. W., Mundt, F., Jensen, L. J. & Mann, M., 2022, I: Nature Biotechnology. 40, s. 692–702

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  135 Citationer (Scopus)

  95 Downloads (Pure)

• Dynamic human liver proteome atlas reveals functional insights into disease pathways

  Niu, L., Geyer, P. E., Gupta, R., Santos, A., Meier, F., Doll, S., Wewer Albrechtsen, N. J., Klein, S., Ortiz, C., Uschner, F. E., Schierwagen, R., Trebicka, J. & Mann, M., 2022, I: Molecular Systems Biology. 18, 5, 24 s., e10947.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  26 Citationer (Scopus)

  29 Downloads (Pure)

• Integrated Liver and Plasma Proteomics in Obese Mice Reveals Complex Metabolic Regulation

  Stocks, B., Gonzalez-Franquesa, A., Borg, M. L., Björnholm, M., Niu, L., Zierath, J. R. & Deshmukh, A. S., 2022, I: Molecular and Cellular Proteomics. 21, 3, 19 s., 100207.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  18 Citationer (Scopus)

  57 Downloads (Pure)

• Noninvasive proteomic biomarkers for alcohol-related liver disease

  Niu, L., Thiele, M., Geyer, P. E., Rasmussen, D. N., Webel, H. E., Santos, A., Gupta, R., Meier, F., Strauss, M., Kjaergaard, M., Lindvig, K., Jacobsen, S., Rasmussen, S., Hansen, T., Krag, A. & Mann, M., 2022, I: Nature Medicine. 28, 6, s. 1277-1287 11 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  124 Citationer (Scopus)

  51 Downloads (Pure)
• 2021

  Defining NASH from a multi-omics systems biology perspective

  Niu, L., Sulek, K., Vasilopoulou, C. G., Santos, A., Wewer Albrechtsen, N. J., Rasmussen, S., Meier, F. & Mann, M., 2021, I: Journal of Clinical Medicine. 10, 20, 22 s., 4673.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  9 Citationer (Scopus)

  38 Downloads (Pure)

• Hepatocyte-specific perturbation of NAD⁺ biosynthetic pathways in mice induces reversible nonalcoholic steatohepatitis-like phenotypes

  Dall, M., Hassing, A. S., Niu, L., Nielsen, T. S., Ingerslev, L. R., Sulek, K., Trammell, S. A. J., Gillum, M. P., Barrès, R., Larsen, S., Poulsen, S. S., Mann, M., Ørskov, C. & Treebak, J. T., 2021, I: Journal of Biological Chemistry. 297, 6, 26 s., 101388.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  24 Citationer (Scopus)

  31 Downloads (Pure)
• 2020

  Plasma proteome profiles treatment efficacy of incretin dual agonism in diet-induced obese female and male mice

  Sachs, S., Niu, L., Geyer, P., Jall, S., Kleinert, M., Feuchtinger, A., Stemmer, K., Brielmeier, M., Finan, B., DiMarchi, R. D., Tschop, M. H., Wewer Albrechtsen, N., Mann, M., Mueller, T. D. & Hofmann, S. M., 2020, I: Diabetes, Obesity and Metabolism. 23, 1, s. 195-207 13 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  16 Citationer (Scopus)

  68 Downloads (Pure)

• Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin

  Dyring-Andersen, B., Løvendorf, M. B., Coscia, F., Santos, A., Møller, L. B. P., Colaço, A. R., Niu, L., Bzorek, M., Doll, S., Andersen, J. L., Clark, R. A., Skov, L., Teunissen, M. B. M. & Mann, M., 2020, I: Nature Communications. 11, 1, 5587.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  82 Citationer (Scopus)

  70 Downloads (Pure)
• 2019

  A spatially resolved proteomic atlas of human skin and its associated immune system

  Dyring-Andersen, B., Coscia, F., Santos, A., Løvendorf, M. B., Sørensen, L. B. P., Niu, L., Andersen, J. L., Clark, R., Skov, L., Teunissen, M. B. & Mann, M., 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S259 1 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

• A spatially resolved proteomic atlas of psoriatic skin

  Dyring-Andersen, B., Lovendorf, M. B., Santos, A., Coscia, F., Sørensen, L. B. P., Niu, L., Andersen, J. L., Teunissen, M. B., Skov, L. & Mann, M., 2019, I: Journal of Investigative Dermatology. 139, 9, suppl., s. S260 1 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

• Plasma proteome profiling discovers novel proteins associated with non-alcoholic fatty liver disease

  Niu, L., Geyer, P. E., Albrechtsen, N. J. W., Gluud, L. L., Santos, A., Doll, S., Treit, P. V., Holst, J. J., Knop, F. K., Vilsbøll, T., Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Müller, T. D., Tschöp, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, M., 2019, I: Molecular Systems Biology. 15, 16 s., e8793.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  179 Citationer (Scopus)

  434 Downloads (Pure)

• Plasma proteome profiling discovers potential biomarkers of non-alcoholic fatty liver disease

  Niu, L., Gupta, R., Geyer, P. E., Albrechtsen, N. J. W., Gluud, L. L., Santos, A., Doll, S., Holst, J. J., Knop, F. K., Vilsbøll, T., Junker, A., Sachs, S., Stemmer, K., Mueller, T. D., Tschoep, M. H., Hofmann, S. M. & Mann, M., aug. 2019, I: Molecular & Cellular Proteomics. 18, 8, s. S71 1 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning

• Plasma Proteome Profiling to detect and avoid sample-related biases in biomarker studies

  Geyer, P. E., Voytik, E., Treit, P. V., Doll, S., Kleinhempel, A., Niu, L., Müller, J. B., Buchholtz, M-L., Bader, J. M., Teupser, D., Holdt, L. M. & Mann, M., 2019, I: EMBO Molecular Medicine. 11, 11, e10427.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  186 Citationer (Scopus)

  235 Downloads (Pure)

• Quick and clean: Cracking sentences encoded in E. coli by LC-MS/MS, de novo sequencing, and dictionary search

  Niu, L. & Mann, M., 2019, I: EuPA Open Proteomics. 22-23, s. 30-35 6 s.

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  3 Citationer (Scopus)

  53 Downloads (Pure)
• 2018

  Constructing a cell-type resolved human liver proteome atlas: THU-034

  Niu, L., Geyer, P. & Mann, M., 2018, I: Journal of Hepatology. 68, s. S138-S139

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › peer review

• Plasma Proteome Profiling Reveals Dynamics of Inflammatory and Lipid Homeostasis Markers after Roux-En-Y Gastric Bypass Surgery

  Wewer Albrechtsen, N. J., Geyer, P. E., Doll, S., Treit, P. V., Bojsen-Møller, K. N., Martinussen, C., Jørgensen, N. B., Torekov, S. S., Meier, F., Niu, L., Santos, A., Keilhauer, E. C., Holst, J. J., Madsbad, S. & Mann, M., 2018, I: Cell Systems. 7, 6, s. 601-612

  Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

  Åben adgang

  Fil
  74 Citationer (Scopus)

  209 Downloads (Pure)

• Proteomics in the Study of Liver Diseases

  Niu, L., Geyer, P. E. & Mann, M., 2018, The Human Gut-Liver-Axis in Health and Disease. Krag, A. & Hansen, T. (red.). Springer, s. 165-193

  Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Forskning › peer review
  4 Citationer (Scopus)